單細胞測序技術又稱“下一代“測序技術或深度測序技術,可以一次性對幾十萬至幾百萬條DNA分子進行序列測定,現(xiàn)已廣泛應用在基因組測序、基因表達分析、非編碼小分子RNA鑒定、轉錄因子靶基因篩選及DNA甲基化等相關的研究領域。
測序技術的突出優(yōu)點是可以從細胞圖譜的角度,探測細胞特異性以及細胞間的差異,探索細胞間的協(xié)同運作方式,研究組織異質性問題,根據(jù)細胞層面的特征對疾病進行深度刻畫,能有效地解決組織樣本無法破解的細胞異質性難題,有助于發(fā)現(xiàn)新的細胞類型。
基于大量的單細胞基因表達數(shù)據(jù),該平臺還可進行細胞表達特征聚類、亞群表達特征、標志物篩選等方面的分析,是一種高效的細胞基因表達水平的檢測技術,在發(fā)育與生殖、免疫、干細胞分化、腫瘤異質性、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育以及腦發(fā)育等研究領域中有著廣泛的應用。
單細胞測序能為單細胞中每個轉錄本標記特異性分子標簽,實現(xiàn)單細胞水平上基因表達譜的定量。同時,每個細胞也會被標記特異性細胞標簽,使得高通量平行建庫成為可能。結合單細胞分離技術,單次實驗可制備100-10000個單細胞文庫,用戶可根據(jù)需求定制引物,將檢測范圍集中在目標基因,大幅降低后續(xù)測序成本。
測序的工作流程包括4個關鍵步驟:1) 單細胞制備,2)單細胞分離和文庫制備,3)測序和初級分析,4)數(shù)據(jù)可視化與解讀。在整個工作流程中,有一些影響結果并決定研究能否成功的實驗注意事項和關鍵步驟。想要獲得準確的數(shù)據(jù),得出有意義的結論,需要精心設計實驗,并按要求開展實驗。
在上述步驟中,單細胞分離的過程往往會對單細胞測序的最終結果產生重大影響。單細胞分離過程太長或者分離時對細胞的損傷太大,都會導致細胞最終的活性狀態(tài)受到較大影響。活性較差的細胞在后續(xù)的單細胞測序中,很難獲得較好的數(shù)據(jù)結果。
Namocell為單細胞測序提供了更好的單細胞分離解決方案。它能幫助用戶快速、高效、輕柔地分選單個目的細胞。儀器配備的散射光和熒光檢測系統(tǒng),可以精確識別用戶感興趣的目的細胞,減少后續(xù)其他細胞的數(shù)據(jù)干擾;快速分選單細胞,最快完成一塊96孔板的分選時間不到1min;系統(tǒng)內部壓力不到2psi,分離過程輕柔,減少細胞在分選過程中的損傷,保證細胞活性。