上海單細胞分離提高了實驗的靈敏度和效率
上海單細胞分離是在單細胞研究中使用廣泛的技術，其高出其他方法幾個數量級的篩選能力和富集細胞的特性讓前面提到的技術*。
上海單細胞分離在基礎研究和臨床中的使用已經成熟。但是，由于對已知免疫特征的依賴，它無法被用來篩選特征未知的異質細胞，而單細胞研究的主旨就是發現未知，這導致其在生物探索領域的功用存在缺憾。另一方面，上海單細胞分離的優勢是富集具有同質免疫特性的細胞，但產物仍然是許多細胞的懸浮液，將其應用于單細胞分選需要比較繁瑣的改進，且仍然缺乏簡便有效的驗證方法，對此目前還沒有商業化解決方案。
對單細胞的研究在上世紀初就已經開展，當時的技術水平只允許在顯微鏡下用口吸式毛細管收集單個細胞。顯微操作技術的應用隨后改變了這種局面，精密設備解放了研究人員的口和手，使得這一過程更加安全、可靠和易控。然而，用這種方式獲取細胞的效率仍然低下，一次操作通常只以獲取少量單細胞為目的，而且過程可 控性低不易重復。因此，該方法更適用于顯微注射而不是單細胞研究。
相比其他需要分解組織以獲取游離細胞的技術，激光顯微切割有著*的*性，該方法利用激光束切割組織切片，因此可以在獲得單細胞的同時保存其在組 織中的空間位置信息，但其劣勢也同樣明顯。細胞形態不規則，損失細胞質甚至是細胞核或是切入相鄰細胞的情況時有發生。另外，在多數情況下細胞因為冷凍或包埋處理，在獲取的同時已經死亡。
基于磁珠的單細胞分離純化方法也被開發出來，其原理也是基于抗體對細胞免疫特征的識別，但實驗要求低，操作相對方便，對細胞的刺激也較小，其短板在于它只能實現正選和反選，即選擇帶有某種標記或不帶標記的細胞，無法利用多通道設計更加精細的篩選方案。
上海單細胞分離技術雖然近得到不少關注， 開展相關實驗的門檻卻是人們不得不正視的一個問題，對大量單細胞進行單獨測序文庫制備的需求與高昂的測序費用之間的矛盾一直是讓不少人感興趣的話題。僅僅是試劑的消耗就可以很快上升到讓人難以承受的程度。因此，利用微流控芯片分離并制備單細胞測序文庫的方案很快就得到了廣泛的關注。
上海單細胞分離不僅大幅降低了實驗成本，還使單個細胞內及其的模板濃縮，提高了實驗的靈敏度和效率。此外，相關技術高度集成化和自動化，能滿足同時處理大量單細胞的需求。
