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三磷酸腺苷（ATP）存在于所有有機物中，是所有活細胞中能量來源的供體。ATP產生于所有生命系統的代謝過程中，因此大多數食物和微生物細胞中都含有一定水平的ATP。ATP熒光檢測儀（配套ATP檢測拭子）采用生物發光技術檢測殘留的ATP，并以此作為表面清潔度的一個指標。若表面檢出較高含量的ATP說明清潔不當，有包括食品殘留、過敏原和/或細菌等污染物存在。這意味著該表面有潛在滋生細菌的可能。

ATP熒光儀顯示的度數單位為RLU值，但它不能區分不能分辨其顯示的RLU讀數是微生物體內的ATP檢測值還是殘留物中的ATP檢測值，或者是兩者的結合。所以不能直接將RLU讀數與標準平板CFU計數換算。但是，ATP水平與微生物數目有著密切的相關性。

根據經驗匯總如下：

>ATP與平板計數CFU的相關性為60－90％，但不會達到100％；

>沒有統計上的顯著差異；

>ATP與CFU間的相關性表明ATP的監控可對表面/機器是否達到運轉所要求的潔凈度做出快速判斷；

>ATP檢測可作為抽檢和初篩手段，結果可疑環節可進一步采樣進行標準平板計數驗證。這樣能夠節省大量的時間進行生產切換。