1、漏氣檢測：首先檢查色譜儀系統是否有明顯的漏氣聲,聽到漏氣的聲音后，可根據聲音的方向逐步定位。這時，可通過涂抹肥皂進一步確定漏氣的發生。找到原因后及時堵漏。
2、柱前壓力觀察：通過觀察色譜儀的柱前壓力指標值，可以迅速判斷故障是由氣源引起的，還是由色譜儀內部氣路的堵塞和損壞引起的。如果柱前壓力過低（準確地說，是低于正常流動操作時的預定壓力值），說明需要檢查氣源；如果柱前壓力正常，則需要檢查儀器的內部氣路。
3、減壓閥的維修：在了解了色譜儀減壓閥的結構后，對減壓閥進行拆裝維修。由于減壓閥進口端壓力較高，如果沒有維修經驗，最好不要盲目拆解。如有可能，建議更換新的閥門；更換閥門時，必須注意氫氣表或氧氣表應與其他氣源表使用的減壓閥分開使用，并在減壓閥上標明其專用氣源名稱。
4、拆除柱子入口處的氣路：拆除色譜儀柱子入口處的氣體接頭，觀察流量計中的轉子是否能升到頂部。如果能升到頂部，說明柱子前面的氣路正常。轉到10進一步檢查；如果轉子不能到達頂部，說明色譜儀柱前的氣路被堵塞，需要進行13檢查。
5、拆下色譜柱出口：將氣相色譜儀的色譜柱進口接回原氣路后，拆下色譜柱出口一側的接頭。這時，觀察流量計中的轉子是否能調整到預定值。若能，則判斷為色譜儀柱后的管路和檢測器堵塞，應按11處理；若仍不能調整轉子，則可認為是柱內填充過緊，需按12進行處理。
6、堵塞的檢查和清除：當判斷色譜儀的柱后管路或檢測器被堵塞時，應排隊清理。
7、柱填料過緊：氣相色譜儀柱填料過緊的主要原因是載體網孔過大，造成氣體阻力過大。適當使用網目數較小的載體或減少色譜柱的長度后，可將流速調整到預定值。
8、拆下流量計的出口口接頭：擰開色譜儀轉子出口端的氣路，觀察轉子是否能上升到高。如果是，則確定是噴射裝置和化油器的氣路堵塞，按14處理；如果轉子仍不能上升到高，可考慮是流量閥損壞或流量計的進氣管道堵塞。此時，按15進行處理。
9、堵塞進樣口：色譜儀進樣器的堵塞，可按注射器的清洗步驟進行。
10、氣相色譜儀的流量閥和管路被堵塞：通過堵塞試驗快速判斷流量管路是否被堵塞。如有，清洗氣體管道；如流量計前的管道正常，可拆開流量控制閥進行清洗。
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