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逆轉錄RT-PCR具體操作步驟
閱讀:15535 發布時間:2021-12-27逆轉錄RT-PCR原理:
提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。RT-PCR使RNA檢測的靈敏性提高了幾個數量級,使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。
逆轉錄RT-PCR操作步驟:
一、RNA逆轉錄cDNA(反應體系要20ul)依次加入
1、Oligo(dT)加入1ul。
2、RNA(體積即上一步驟計算出來的)
3、剩下的用無Rnase水補齊共12ul 65℃水浴5min。
二、加入逆轉錄試劑
1、5×Reaction Buffer 4ul
2、Ribolock RNase Inhibiter 1ul
3、10mM Dntp mix 2ul
4、RevertAid m-mul URT 1ul
三、設置儀器,按照說明書設置
1、oligodT:42℃ 60min
2、逆轉錄:70℃ 5min
3、終止:4℃
附加:cDNA可以跑電泳看一下,取cDNA 1ul加load buffer(看這個是幾乘的)混勻,跑電泳,marker用2000的取6ul左右膠板的制作,后面有說明。
四、PCR cDNA擴增目的基因(反應體系是20ul,不夠用無菌水補齊)
下面的實驗用高壓過的槍頭和普通高壓過的水即可。(所用以下配比物品都要在冰箱中凍存,使用之前離心,甩下來即可。量大的話可以先加樣配比,即把所需要的試劑總量計算出后,取出放在ep管中。)
1、加樣:①Mix 10ul ②引物 1ul ③cDNA和水總計9ul
2、混勻:小離心機甩一下即可
3、放入PCR儀:PCR儀事先設定條件,反應條件根據mix說明書來設定
4、PCR產物保存:一般在4℃冰箱保存,長時間不用可-20℃凍存。
五、配膠和跑膠:
1、配膠: (水平膠;瓊脂糖凝膠)要帶手套,TAE有毒。
小膠板8孔的 TAE 25ml 瓊脂糖 0.25~0.30g
中膠板25孔的 TAE 50ml 瓊脂糖 0.50~0.55g
步驟:稱取BIOWEST AGAROSE(瓊脂糖)放入配膠專用燒瓶→用配膠專用量筒量1×TAE倒入燒瓶→酒精燈加熱(以看到冒泡為準)→將沸騰的液體轉移到EB污染區的燒瓶中→加入EB或EB替代(觀察顏色不是很深即可,一般小膠板3滴左右)→插梳子→倒入電泳槽(倒膠從一個角倒入防止產生氣泡)→待膠凝固30分鐘左右拔出梳子進行跑膠(如不馬上跑將膠放4℃冰箱保存,防止膠變干)。
2、跑膠:
(1)電泳緩沖液用1×TAE,一般跑5-8次膠后就要重新換電泳緩沖液。
(2)要讓緩沖液沒過膠。
(3)Marker標記染色體上一個可以被識別的區域,我們用的是2000的(保存在4℃冰箱中):3-6ul單格加入。
步驟:取PCR產物(cDNA)8ul,加入單格上,接通電源,跑膠。(注意:跑膠方向是從負極到正極),當loading Buffer跑到2/3時停止跑膠(大約40分鐘),帶手套取膠放在照相臺上。
六、照相