顯微鏡數碼成像系統具有顯微攝像功能，把觀察到的顯微效果保存下來，形成圖文文件，可給相關部門互相傳閱；光學顯微鏡只能通過目鏡觀察，不能進行顯微攝像。
隨著科學技術的飛速發展，數碼相機成像技術的應用越來越廣泛。數碼相機和顯微鏡的相結合又是一次經典的應用，我們在顯微鏡的基礎上，利用數碼相機現有的拍攝技術，就可以拍攝出清晰度高、質感好、飽和度強的數碼顯微照片，憑借多年的顯微生產技術，使顯微鏡和數碼相機達到最佳的組合效果。
顯微鏡數碼成像系統一般由載物臺、聚光照明系統、物鏡，目鏡和調焦機構組成：
1、載物臺用于承放被觀察的物體.顯微鏡最好安裝移動尺或機械載物臺。否則直接用手移動，觀看標本時會不精確。移動尺實惠些，價格低廉，機械載物臺高配些，精確度更高，使用壽命更長。
2、聚光照明系統由燈源和聚光鏡構成，聚光鏡的功能是使更多的光能集中到被觀察的部位.照明燈的光譜特性必須與顯微鏡的接收器的工作波段相適應。
3、物鏡位于被觀察物體附近，是實現第一級放大的鏡頭.在物鏡轉換器上同時裝著幾個不同放大倍率的物鏡，轉動轉換器就可讓不同倍率的物鏡進入工作光路，物鏡的放大倍率通常為4～100倍.物鏡是顯微鏡中對成象質量優劣起決定性作用的光學元件.常用的有能對兩種顏色的光線校正色差的消色差物鏡；質量更高的還有能對三種色光校正色差的復消色差物鏡。
4、目鏡是位于人眼附近實現第二級放大的鏡頭，鏡放大倍率通常為5～20倍.按照所能看到的視場大小，目鏡可分為視場較小的普通目鏡，和視場較大的大視場目鏡(或稱廣角目鏡)兩類。
5、光學顯微鏡只是光學元件和精密機械元件的組合，它以人眼作為接收器來觀察放大的像。
