化工儀器網(wǎng)
技術(shù)文章
研究分析了免疫細(xì)胞動(dòng)態(tài)遷移和狀態(tài)轉(zhuǎn)化的特征
閱讀：566 發(fā)布時(shí)間：2020-1-1肝細(xì)胞癌是世界范圍內(nèi)死亡率*三的癌癥，其中中國的肝癌發(fā)病率居世界。免疫逃逸被認(rèn)為是癌癥發(fā)展的標(biāo)志之一。
北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、北京未來基因診斷高精尖創(chuàng)新中心（ICG）、生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）張澤民課題組、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院彭吉潤課題組以及德國藥企勃林格殷格翰（Boehringer Ingelheim）公司腫瘤免疫與免疫調(diào)節(jié)部門多位科學(xué)家結(jié)合10x Genomics和SMART-seq2單細(xì)胞RNA測序技術(shù)，對肝癌患者多個(gè)組織的免疫細(xì)胞做出了系統(tǒng)性的刻畫，分析了免疫細(xì)胞動(dòng)態(tài)遷移和狀態(tài)轉(zhuǎn)化的特征，描繪了腫瘤浸潤免疫細(xì)胞跨組織的動(dòng)態(tài)過程，探索了它們在肝癌治療上的潛在價(jià)值。
目前研究表明，腫瘤存在多種免疫逃逸機(jī)制，提出了研究腫瘤微環(huán)境中不同免疫細(xì)胞狀態(tài)的重要性。而不同類型的單細(xì)胞測序技術(shù)則是研究不同類型免疫細(xì)胞的狀態(tài)和動(dòng)態(tài)的有力手段。
該研究課題組組長表示，癌癥免疫療法是近年新興的治療方法，逐漸成為癌癥治療領(lǐng)域的新趨勢，被認(rèn)為是能夠*治愈惡性腫瘤的希望所在。肝癌微環(huán)境中不同免疫細(xì)胞的狀態(tài)，在單細(xì)胞水平上描繪肝癌免疫微環(huán)境的動(dòng)態(tài)特征，為更多的肝癌患者帶來希望。
這次合作迸發(fā)出對肝癌的免疫微環(huán)境的重要新洞見，揭示了免疫細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境和其他免疫組織之間的動(dòng)態(tài)遷移變化。這份結(jié)合前沿的生信分析技術(shù)和生物學(xué)驗(yàn)證手段的工作還暗示了免疫細(xì)胞遷移理念也適用于其他腫瘤類型的可能性。
目前單細(xì)胞測序技術(shù)已經(jīng)成為探究細(xì)胞類群多樣性的常用技術(shù)手段，而不同的測序技術(shù)在細(xì)胞捕獲和基因捕獲效率上具有各自不同的優(yōu)勢[3]。本研究結(jié)合了SMART-seq2和10x Genomics Chromium 3’兩種單細(xì)胞測序技術(shù)，并整合這兩種平臺的數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析，充分發(fā)揮不同數(shù)據(jù)類型的優(yōu)勢，獲得高分辨率的肝癌免疫圖譜。
癌旁組織和外周血是腫瘤相關(guān)研究中常用的對照組織，而其他相關(guān)的免疫器官或病理組織則較少受到關(guān)注。例如，腹水是肝癌患者常見的病理現(xiàn)象，其產(chǎn)生與肝癌預(yù)后不良有關(guān)，然而腹水中的免疫細(xì)胞組成及其與肝癌的聯(lián)系尚不清楚。因此，研究收集肝癌病人的癌組織、癌旁組織、淋巴結(jié)、外周血和腹水五種組織的CD45+免疫細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，并分析肝癌免疫微環(huán)境中的細(xì)胞類型、表達(dá)特征，以及不同組織之間細(xì)胞的動(dòng)態(tài)變化與聯(lián)系。
腫瘤浸潤性的LAMP3+DC發(fā)揮了廣泛調(diào)節(jié)淋巴細(xì)胞的作用，它們與T細(xì)胞和NK細(xì)胞上表達(dá)的配體-受體相互作用數(shù)量多。LAMP3+DC通過CCL19-CCR7和CCL22-CCR4吸引T細(xì)胞，并通過CD86-CD28作用于調(diào)節(jié)T細(xì)胞亞群，通過CD86-CTLA4作用于耗竭性T細(xì)胞亞群。研究者通過多色免疫組化對表達(dá)PD-1點(diǎn)T細(xì)胞與表達(dá)PD-L1的LAMP3+DC進(jìn)行了空間位置的判斷，發(fā)現(xiàn)其出現(xiàn)出相鄰的位置，為其相互作用提供了另一角度的證據(jù)。
研究*對肝癌臨床樣本進(jìn)行包括病理組織在內(nèi)的多組織位點(diǎn)的收集，并利用前沿的生物信息學(xué)分析方法，通過自體對照，不僅描述了肝癌微環(huán)境的免疫組分和狀態(tài)，而且描繪了腫瘤浸潤免疫細(xì)胞跨組織的動(dòng)態(tài)過程。此項(xiàng)的開創(chuàng)性工作，可為人們研究肝癌和其他疾病中的免疫細(xì)胞，以及開發(fā)新的臨床檢測與治療方案提供新的思路。