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技術文章

T7 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒使用手冊V1.1

閱讀:3527          發(fā)布時間:2019-5-17

T7 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒產(chǎn)品及特點 本試劑盒是基于 T7 RNA 聚合酶的 RNA 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒,它利用含有 T7
啟動子的模版 DNA,以 NTP 為底物,從 T7 啟動子下游開始合成與模版 DNA
中一條鏈互補的 RNA,簡單快速獲得大量的 RNA 分子。本產(chǎn)品具有下列特點:
1. 即開即用,用戶只需提供含T7 啟動子的DNA 模板即可以進行體外轉(zhuǎn)錄實驗,
不需要單獨準備每一個成份。
2. 單溶液預配液,減少加樣次數(shù),避免了操作誤差,增加了可重復性。
3. 模版 DNA 可以是線性化的質(zhì)粒 DNA,也可以是 PCR 擴增產(chǎn)物。
4. 可以合成的 RNA 的長度在 20nt 到 2000 nt 之間。
5. 產(chǎn)品配方經(jīng)過精心優(yōu)化,每 ug DNA 模版可以合成 2-6 ug RNA。
6. 得到的 RNA 可以用于 RNA 結(jié)構研究、核酶生物化學、體外翻譯、RNA-蛋
白質(zhì)相互作用、反義技術、SELEX 技術和 RNA 干擾(RNAi)等實驗。
7. 本試劑盒足夠 50 次 20uL 體系的體外轉(zhuǎn)錄實驗。 規(guī)格及成分 成份 編號 十孔盒包裝
T7 轉(zhuǎn)錄預配液(2×) 91106a 0.5 mL
陽性對照 DNA(1.3 Kb 片段) 91106b
20 uL
(10 ng/uL)
T7 RNA 聚合酶 91106c 50 uL
RNase-free 水 80403 1 mL
使用手冊 91106sc 1 份
運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存、有效期一年。 自備試劑 Tris 飽和酚、RNase-free 75%乙醇(均可從本公司另購)
相關資料 一、制備 DNA 模板(本試劑盒不含所需試劑,此處信息僅供參考)
PCR 片段和質(zhì)粒 DNA 都可以用作體外轉(zhuǎn)錄的模板,但是必須注意以下幾
點。
一是必須使用線性化的 DNA。如果是質(zhì)粒 DNA,則必須先用適當?shù)南拗菩?br />內(nèi)切酶切成線狀。
二是需要轉(zhuǎn)錄的DNA 序列的上游必須有T7 啟動子。如果模板是PCR 產(chǎn)物,
則可以在設計引物時將 T7 啟動子序列(5’TAA TAC GAC TCA CTA TAG
GG 3’)加上。如果是將 DNA 片段克隆到載體上,則需要選擇有 T7 啟動
子的載體,并且克隆位點必須位于 T7 啟動子下游。
三是需要轉(zhuǎn)錄的 DNA 序列的下游端不要是 3’突出。如果是 3’突出
(比如選擇了 Pst I 來線性化質(zhì)粒),則用 T4 DNA 聚合酶修平。
四是必須保證 DNA 模板中沒有 RNase。由于提取質(zhì)粒 DNA 的過程中一般
要使用大量的 RNase A,因此質(zhì)粒 DNA 一般都有嚴重的 RNase A 污染,
所以在用作模板前,采取膠回收得方法回收質(zhì)粒 DNA。并且加入少量
總 RNA 一起保溫,然后電泳檢測 RNA 是否被降解,以此來判斷純化的 DNA
模板是否有殘留 RNase A。如果有 RNase 污染,則必須反復酚-抽提
去除殘留的 RNase,然后再乙醇沉淀質(zhì)粒 DNA。
二、體外轉(zhuǎn)錄反應
1. 在兩個 RNase-free 的塑料離心管中,在室溫下(不是在 4℃下)分別按次
序加入下列成分(T7 轉(zhuǎn)錄預配液容易產(chǎn)生結(jié)晶沉淀,一定要握在手中直到
結(jié)晶*溶解并搖勻后方可使用):
注:此為 20uL 反應體系的用量,對其他反應體系,各成分的用量可以
按比例增減。本產(chǎn)品的 T7 轉(zhuǎn)錄預配液已經(jīng)含有NTP。如果需要標記 RNA
探針,則需要訂購 NTP 分開的試劑盒。如果需要得到加帽 RNA,則需
要加入自備的加帽修飾核苷酸(NEB 公司有此產(chǎn)品)。
2. 37℃保溫 1-2 小時。注意:延長保溫時間并不能提高產(chǎn)量。
3. 70℃加熱 10 分鐘滅活 T7 RNA 聚合酶。
4. 取 1-3 uL 電泳檢測轉(zhuǎn)錄效果。一般 1 ug DNA 可以合成 5-10 ug 的 RNA。
5. 得到的 RNA 可以放-80℃保存。如需去除 DNA 模板,請按下面步驟操作。
三、去除 DNA 模板(所需試劑需要另購)
1. 在體外轉(zhuǎn)錄體系中加入 1 uL 自備的 RNase-free DNase (3-5 U/uL)。
成分 樣品管 對照管
DNA 模板
PCR 片段
質(zhì)粒 DNA
50 ng 左右
1 ug 左右
不加
陽性對照片段 不加 4 uL
T7 轉(zhuǎn)錄預配液,2× 10 uL 10 uL
T7 RNA 聚合酶 1 uL 1 uL
RNase-free 水 補水到 20uL 補水到 20uL
2. 37℃保溫 15-30 分鐘。
3. 補水到 100 uL。
4. 用自備的等體積(100 uL)的 Tris 飽和酚-抽提一次去除殘留的 DNase
和 RNA 聚合酶。
5. 加自備的 200 uL 無水乙醇,振蕩后 15000 rpm 離心 20-30 分鐘,棄上
清(含 NTP 和鹽離子等成分)。
6. 加入 1mL 75%乙醇,震蕩 10秒后15000rpm 離心3-5 分鐘,棄上清。
7. 短暫離心數(shù)秒,用槍頭吸棄上清。
8. 晾干,所得沉淀即體外轉(zhuǎn)錄所得的 RNA。可溶于 RNase-free 水中后立即
使用或放-80℃長期保存。 疑難解答 1、沒有 RNA 產(chǎn)物。常見原因是模板有 RNase 污染,可用純化的 RNA 跟模
板DNA 一起保溫,再檢測 RNA 是否降解。還可以增加 RNase Inhibitor
用量,本試劑盒緩沖液和酶混合液中有 RNase inhibitor,如果模板 RNase
污染嚴重,可能需要用戶補加 RNase inhibitor。
2、RNA 產(chǎn)量低。常見的原因是 DNA 模板。在轉(zhuǎn)錄序列的個和第二個堿
基都是 G,在前 14 個堿基內(nèi)避免有 U 存在。
3、RNA 長度比預期的短。可能是模板序列中有 T7 RNA 聚合酶的終止序列。
可以改用 SP6 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒(啟動子也必須改成 SP6 啟動子)。
4、RNA 長度比預計的長。T7 RNA 聚合酶跟 Taq DNA 聚合酶一樣,有不依賴
于模板的加尾功能,多有一半的 RNA 可以帶一個或兩個堿基的尾巴。如
果 RNA 長度比預計的長很多,使用的模板又是質(zhì)粒 DNA,則可能是質(zhì)粒
DNA 線性化不*。
5、5’單磷酸還是三磷酸。如果使用 GTP,則得到的 RNA 是三磷酸,體外轉(zhuǎn)
錄時如果保溫時間太長(如 12 小時),則有 50%的三磷酸會變成單磷酸。
如果在轉(zhuǎn)錄體系中加入 GMP,則 T7 RNA 聚合酶將優(yōu)先使用 GMP,所得
RNA 產(chǎn)物中 5’端是單磷酸的比例將大大增加。
6、用體外轉(zhuǎn)錄試劑盒如何得到帶帽 RNA?
7、需加入帶帽 NTP 類似物即可。 關聯(lián)產(chǎn)品 SP6 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒 (CAT#:91106-50)
180413d

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