凝膠遷移或電泳遷移率實驗 (electrophoretic mobility shift assay, EMSA)是一種體外研究DNA結(jié)合蛋白（轉(zhuǎn)錄因子）和其相關(guān)的DNA結(jié)合序列（靶標基因的啟動子序列）相互作用的技術(shù)，可用于定性和定量分析。 

EMSA，知其所以然！ 

正如上方實驗示意圖所示， 蛋白質(zhì)可以與核酸探針結(jié)合，電泳時這種復合物比無蛋白結(jié)合的探針在凝膠中泳動的速度慢，即表現(xiàn)為相對滯后。通過競爭性對照組，可以驗證實驗的特異性。 

EMSA，難點與痛點

EMSA實驗是很多實驗新手的攔路虎，不僅實驗步驟繁瑣（凝膠電泳，轉(zhuǎn)膜，紫外交聯(lián)，信號檢測），而且實驗與對照組較多（通常為5組，標記探針、標記探針+蛋白、標記探針+蛋白+未標記探針（特異競爭寡核苷酸）、標記探針+蛋白+未標記突變探針、標記探針+蛋白+抗體），經(jīng)過多次測試優(yōu)化才能獲得理想的實驗結(jié)果，綜合成本非常高。 

突破EMSA，創(chuàng)新的新方法，Nature為您測試： 

作為表觀遺傳學的專業(yè)解決方案供應(yīng)商，艾美捷科技為您推薦，Epigentek品牌創(chuàng)新推出的通用蛋白-DNA結(jié)合分析試劑盒（比色法）：

* 客戶需自行準備如下材料：[1]生物素標記的特異性探針; [2]未標記的特異性探針；[3]目標蛋白的一抗與HRP-二抗

通用蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合分析試劑盒原理： 

通用蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合分析試劑盒（比色），用于測量核提取物中轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合活性。在實驗中，含有靶向轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合共有序列的生物素標記的雙鏈寡核苷酸（寡核苷酸）與結(jié)合試驗緩沖液中的核提取物一起溫育。核提取物中活性形式的轉(zhuǎn)錄因子與其共有序列結(jié)合。然后將寡蛋白復合物捕獲到測定微孔上。靶蛋白可以通過高親和力抗體識別，并通過檢測抗體 - 顯色試劑反應(yīng)系統(tǒng)進行比色測量。 

產(chǎn)品特點與優(yōu)勢： 

• 快的程序：完整的檢測可在3小時內(nèi)完成。
• 可拆卸微孔板，使測定靈活：手動或高通量分析。
• 比色法分析，無放射性材料，更安全。
• 簡單，可靠，一致的檢測條件。 

Nature文章發(fā)表結(jié)果： 

《Klengel, Torsten, et al. "Allele-specific FKBP5 DNA demethylation mediates gene–childhood trauma interactions." Nature neuroscience 16.1 (2013): 33.》

rs1360780基因的A/G等位基因與TBP的結(jié)合能力分析，A等位基因的親和力明顯高于G. 

更多發(fā)表文章，歡迎了解：

Hekmat-Scafe DS et. al. (November 2016). Using yeast to determine the functional consequences of mutations in the human p53 tumor suppressor gene: An introductory course-based undergraduate research experience in molecular and cell biology.Biochem Mol Biol Educ.

Jang JY et. al. (February 2016). Targeting adenine nucleotide translocase-2 (ANT2) to overcome resistance to epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor in non-small cell lung cancer. Mol Cancer Ther. 

Koh J et. al. (October 2015). EML4-ALK enhances programmed cell death-ligand 1 expression in pulmonary adenocarcinoma via hypoxia-inducible factor (HIF)-1α and STAT3 OncoImmunology. 

Gao Y The Univer et. al. (June 2014). Up-regulation of Hepatic VLDLR via PPARα Is Required for the Triglyceride-Lowering Effect of Fenofibrate. J Lipid Res. 

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