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小麥白粉病的高光譜成像早期診斷和發病機制監測

閱讀:1039      發布時間:2022-10-27
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白粉病是一種世界性的小麥真菌病害,是造成小麥產量損失和品質下降的主要原因。小麥白粉病在侵染初期是無癥狀的,通常根據侵染后期出現的一些可見癥狀由人工檢測方式鑒定,所以不僅費時、費力、易出錯,且因感染時間滯后而不能有效控制疫情。小麥白粉病的早期診斷成為進一步預防病害蔓延的重大要求,也有助于減少殺菌劑的應用。然而高光譜成像作為一種無損檢測技術,在小麥白粉病的早期診斷和發病機制監測方面具有潛力。

山東農業大學邵園園副教授團隊利用我司高光譜設備,以白粉病脅迫下小麥葉片為研究對象,首先在接種前、后分別采集健康0天和2~5天染病樣本的高光譜圖像。選擇800nm左右的高光譜圖像作為掩膜對象,設置閾值為0.12創建二值圖像。選取剔除兩端的每片葉片作為感興趣區域(ROI),如圖1所示。

圖1高光譜圖像的采集與處理

圖2 小麥白粉病高光譜時序響應特征曲線

獲取小麥白粉病高光譜時序響應特征(圖2)。隨后利用主成分分析(PCA)觀察不同感染階段樣本間的區分能力,觀測分析了不同染病階段樣本的分類散點圖(圖3)、主成分特征圖像與載荷曲線(圖4)

圖3 不同染病階段樣本的分類散點圖

圖4 PC特征圖像(a)和載荷曲線(b)

圖5特征波段提取

圖5顯示利用連續投影算法(SPA)進行特征波長選擇的過程。當RMSE達到*值0.31時,確定了12個特征波長,分別是457,491,540,634,677,790,831,857,888,933,952,967nm。*終以光譜數據建立PLS-DA模型得到校正和交叉驗證的總分類準確率分別為93.8%和89.2%,在驗證集的預測中,總分類準確率為88.6%。利用灰度共生矩陣(GLCM)從前3張PC得分圖像中提取3種紋理特征(能量、熵和對比度),生成9個紋理變量。由紋理特征建立PLS-DA模型,*終得到校準、交叉驗證和驗證中總分類準確率分別為74.6%、73.8%和70.0%。

圖6 紋理特征箱線圖

將高光譜圖像的光譜和紋理特征融合,建立PLS-DA模型。融合數據每個樣本產生21個變量,包括12個特征波長和9個紋理特征。校正和交叉驗證的總分類精度分別為97.7%和93.8%,在驗證集的預測中,總分類準確率高達91.4%。此外,借助光譜角映射(SAM)方法進行不同染病階段的病斑識別,實現了小麥白粉病發病過程可視化監測(圖7)。

圖7 SAM病斑識別與發病過程可視化監測

本文采用的高光譜設備具體參數如圖8所示。

圖8 Gaiafiled-Pro-V10E相機及參數

通訊作者簡介:

邵園園,工學博士,山東農業大學副教授,碩士生導師。

主要研究方向:1、農業機械設計,包括播種育苗移栽機械、免耕播種機械、秸稈后處理機械及蘋果、花生、甘薯收獲機械等。

2、機構運動與動力學優化仿真;精準農業、農產品檢測、圖像識別、高光譜圖像處理等。

參考文獻:Xuan G , Li Q, Shao Y , et al. Early diagnosis and pathogenesis monitoring of wheat powdery mildew caused by blumeria graminis using hyperspectral imaging[J]. Computers and Electronics in Agriculture, 197(2022): 106921.


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