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細胞實驗室中最常見的儀器設備就是倒置顯微鏡，其作用是掌握細胞的生長情況，并觀察其有無受到污染。如果預算充足，還可配備相差顯微鏡、解剖顯微鏡、熒光顯微鏡、錄像系統，從而能更好的觀察、記錄、拍攝細胞的生長情況。

如果需要對細胞實驗室內的實驗用細胞進行體外培養，那么必須把相關細胞放入培養箱。因為大多數情況下，適合細胞生存的溫度為37℃（溫差±0.5℃），如果升高2℃，細胞只能存活數小時，如果達到40℃，細胞將很快死亡。

目前，細胞實驗室中最常見的培養箱是CO2培養箱，其優點在于能夠提供定量的CO2（濃度為5％），使培養液的pH保持穩定，適用于開放或半開放培養。培養箱中放置用于培養細胞的培養皿、培養板或培養瓶，如果要使用培養瓶，建議把瓶蓋略微旋松，確保通氣狀態。

培養箱的相關器械、器皿需要消毒、烘干后方能使用，因此細胞實驗室必須配備干燥箱才行。常見的干燥箱是鼓風式電熱干燥箱，其優點在于溫度均勻、干燥效果較好。

至于干燥箱的使用，鼓風與升溫必須同時進行，到100℃時停止鼓風，以免包裹器皿的紙或棉花燒焦，造成污染。消毒后不能立刻打開干燥箱的門，而是要等待幾分鐘，以免造成器皿損壞。

細胞培養有著較高的水質要求，所以相關用水必須經過水純化裝置的處理。以細胞培養時配制各種培養液及試劑為例，需要使用3次蒸餾水，就算是沖洗器皿，也要用2次蒸餾水。

細胞實驗室中的冰箱分為普通冰箱或冷藏柜、低溫冰箱與超低溫冰箱2類。其中，前者用于儲存培養液、生理鹽水及相關培養用物品與短期保存組織標本。后者用于儲存需要冷凍保存生物活性及較長時期存放的制劑，如酶、血清等。 

這里說的細胞冷凍儲存器為液氮容器，其作用是冷凍儲存實驗項目所需的細胞。選擇液氮容器時需要從3方面來考慮，即：容積大小、取放使用方便、液氮揮發量。液氮容器的大小在25L-500L左右，可以儲存1ml的安瓿250-15000個左右。

由于液氮的溫度為-196℃，所以使用時要小心，以免出現凍傷。此外，由于液氮不斷揮發，還要注意存留液氮的情況，如果液氮量不足要及時補充，以免揮發過多而致細胞受損。

細胞培養通常分為3項工作，即：制備細胞懸液、調整細胞密度、洗滌與收集細胞。這3項工作都離不開離心機，所以它也是細胞實驗室內必*儀器設備。

如果細胞實驗室沒有特殊要求的話，可配置4000rpm的臺式離心機。如果有細胞沉降需求，可配置80-00g的離心機。如果有梯度離心需求，可配置具有此功能的離心機。此外，也可根據需要配置大容量或可調節溫度的離心機。

細胞實驗室內的天平有扭力天平、精密天平，至于如何選擇，要根據稱取物的量和稱量精度來定。如果取樣量＞100 mg，選用感量為0.1mg天平。如果取樣量為10mg-100mg，選用感量為0.01mg 天平。如果取樣量＜10mg，選用感量為0.001 mg天平。

只要與細胞產生接觸的物品，不管是直接還是間接接觸，都要通過消毒器消毒滅菌處理。建議細胞實驗室內配置高壓滅菌型消毒器——脈動真空滅菌器，其特點是可在消毒滅菌的同時監測滅菌容器內的壓力和溫度，且能通過記憶支持系統改變各種參數，確保滅菌質量和安全。

用于細胞培養的培養液需要通過濾器進行消毒，目前常使用的濾器有3種，即：Zeiss濾器、玻璃濾器、微孔濾器。