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微生物菌種本屬的產毒霉菌主要包括黃曲霉、寄生曲霉、雜色曲霉、構巢曲霉和棕曲霉。這些霉菌的代謝產物為黃曲霉素，雜色曲霉素和棕曲霉素。
曲霉屬的顏色多樣，而且比較穩定，營養菌絲體由具有橫隔的分枝菌絲構成，無色或有明亮的顏色，一部分埋伏型，一部分氣生型。分生孢子梗大都無橫隔，光滑，粗糙或有麻點。梗的頂端膨大形成棍棒形，橢圓形，半球形或球形的頂囊，在頂囊上生出一層或兩層小梗，雙層時下面一層為梗基，每個梗基上再著生兩個或幾個小梗，從每個小梗的頂端相繼生出一串分生孢子，由頂囊，小梗以及分生孢子鏈構成一個頭狀體結構，稱為分生孢子頭，分生孢子頭由各種不同的顏色和形狀，如球形，放射形，棍棒形或直柱形等，曲霉屬只有少數種形成有性階段，產生封閉式的閉囊殼，某些種產生菌核或菌核結構，少數種可產生不同形狀的殼細胞。
其中黃曲霉是曲霉屬中非常常見的一中，黃曲霉在察氏瓊脂培養基上菌落生長較快，10d~14d直徑3cm~4cm或4cm~7cm，zui初帶黃色，然后變為黃綠色，老后顏色變暗，平坦或有放射狀溝紋，反面無色或帶褐色，在低倍顯微鏡下觀察可見分生孢子頭疏松放射狀，繼變為疏松柱狀，分生孢子梗多從基質生出，長度一般小于1mm。有些菌絲產生帶褐色的菌核，微生物菌種制片鏡檢觀察可見分生孢子梗極粗糙，直徑10μm~20μm。頂囊燒瓶形或近球形，直徑10μm~65μm，一般多為25μm~45μm，全部頂囊著生小梗，小梗單層，雙層或單、雙層同時生在一個頂囊上，梗基（6μm~10μm）×（4μm~5.5μm），小梗（6.5μm~10μm）×（3μm~5μm），分生孢子球形近球形或稍作洋梨形，3μm~6μm，粗糙。
阪崎腸桿菌    Enterobacter sakazakii
福氏志賀氏菌    Shigella flexneri
蠟樣芽孢桿菌    Bacillus cereus
乙型副傷寒沙門氏菌    Salmonella paratyphi β
大腸埃希氏菌    Escherichia coli
金黃色葡萄球菌    Staphylococcus aureus
乙型溶血性鏈球菌    Streptococcus hemolytic-β
里氏木霉    Trichoderma reesei
雞白痢沙門氏菌    Salmonella pullorum
膠質芽孢桿菌    BacillusmucilaginosusKrassilnikov
羊肚菌屬    Morchella sp.
嗜酸乳桿菌    Lactobacillus acidophilus
植物乳桿菌    Lactobacillusphantarum(Orla-Jehsen)Holland
藍色犁頭霉    Absidia coerulea
微生物菌種