由于熒光定量PCR方法的快速、靈敏、定量的特點，其在研究及開發方面的應用很多，如
⑴ 病原體檢測
⑵ 產前診斷
⑶ 藥物療效考核
⑷ 腫瘤基因檢測
實時熒光定量PCR的結果該怎樣分析？
1、如果有標準曲線，按照標準曲線計算；
2、一般都是相對量，則用delta delta CT方法來計算；
3、引物或探針降解：可通過PAGE電泳檢測其完整性；
4、模板量不足：對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起；
5、看CT值是分析熒光定量PCR最直觀的一個數據，CT值一般在35左右就失去參考價值了，平時我們實驗室用BIODAI-PCR熒光定量法測得的擴增曲線的起跳值基本在30左右。
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