關于固相萃取(SPE)，有三大zui常見的問題，分別是：回收率低、重現性差和樣品提取物不夠純凈。

　　要解決回收率和重現性的問題，首先我們要驗證分析系統的運行情況是否正常。

　　重現性的問題可能由以下幾種情況引起：

　　樣品的殘留，檢測器問題或有缺陷的自動進樣器。

　　可以通過將含有已知標準樣品的提取溶劑注入儀器，來驗證分析儀器的響應因子是否發生了改變。重復進樣純標準可以驗證進樣的重現性，而重復進樣不同濃度的標準（濃度由高到底，甚至到非常低的水平)可以驗證殘留問題。

　　然后需要對SPE操作的每一步進行評估，因為如果分析物在任何地方發生了損失都會導致較低的回收率。

　　該評估首先需要制定萃取過程的標準流程，然后收集每一個擬定步驟中的餾分，zui后進行分析以確定分析物是否正在流失。如果發現是在載樣過程或清洗步驟的話，就要檢查這些步驟中所使用的溶劑、采用的條件或預平衡等是否正確，因為這些因素的影響都具有保留性。

　　嘗試改變樣品溶劑或洗滌步驟，以提高吸附劑的保留機制。

　　如果分析物是被保留在柱上但不能很好地被洗脫，那需要表明溶劑是正確的，然后需要增加洗脫劑的洗脫強度。此外，分析物與吸附劑兩者可能存在二次相互作用，所以應選擇合適的洗脫溶劑來解決這一問題。zui后，也許有必要更換一種對目標成分保留性弱的吸附劑。

　　如果SPE操作過程一切正確，那很可能被分析物并未吸附在柱上或進入柱后直接被破壞掉了，所以在餾分中檢測不到分析物。

　　前者的問題可能是由于樣品中的分析物不穩定導致；同時假如樣品預處理過程涉及到蛋白質沉淀而目標分析物會與蛋白質發生結合，那么分析物就隨蛋白質一同沉淀也會導致上述問題。

　　另外，生成的與蛋白結合的分析物可能直接通過固相萃取柱而不被吸附，故也不可能在后續的分析步驟中被檢測到。

　　當使用液相色譜-質譜法（LC-MS）時，基質會抑制或增強目標分析物的信號。因此如果干擾物質不能使用SPE技術很好的消除的話，那么其他的預處理步驟就顯得尤為必需了，如：液-液萃取技術常用來去除油、脂肪或油脂；離子交換技術常用來脫鹽，或使用非極性吸附劑去除無機鹽；通過調節pH值、超濾或沉淀等操作來去除那些會結合分析物的蛋白質等。

　　如果出現回收率較之前下降或波動較大的情況，你應該檢查一下使用的吸附劑，這可能是由于使用的吸附劑批次不同導致的。

　　當出現重現性變差、柱故障（如高背壓或保留時間發生改變）以及定量不準等現象，那就需要進一步對樣品進行凈化。

　　解決這個問題可采用的方法是改變原來的洗滌方案，或使用具有相同萃取機理的其它吸附劑，或*改變萃取方法。

　　洗滌溶劑應該具有這樣的機制：可洗脫zui大量的干擾物質而分析物不被洗脫。

　　淋洗步驟也可以通過使用分析物不可溶的溶劑來改善——然而,驚人的凈化效果則可能是通過使用非極性的與水不互溶的溶劑，如二氯甲烷、乙酸乙酯或己烷來實現。

　　這些溶劑具有很強的非極性機制的洗脫特性（如它們可以洗脫許多干擾物），而分析物將被牢牢地保留在吸附劑表面。洗脫溶劑也可以調整，較弱的溶劑也可能獲得更純凈的提取物，但同時需要關注對分析物回收率是否造成影響。

　　如果即使改變了洗滌溶劑但仍然不能獲得理想的純凈的分析物，可以嘗試改變吸附劑。 例如，如果采用C8吸附劑、低保留力的C4或C2吸附劑等，它們對基質成分的吸附能力都比較差。然而，同時你也必須確保樣品能充分地吸附在固定相上。

　　提高樣品純凈度的zui后一個方法是*改變萃取機理。

　　合適的替代品可以用來開發和確定具有潛在的可用機制的方法。目前有一種很有效的技術就是采用混合機制的提取技術來替代傳統的單一機制的提取技術。這種方法用于提取既含有極性基團又含有非極性基團的分析物。