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糞便預測大腸癌

時間:2015-10-19閱讀:813
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根據一項新的調查研究顯示,通過分析大腸癌患者病灶附近的微生物組群相比于傳統的血液檢測有很多的優點:靈敏度與特異性都要更高,而且無創。

“大腸癌患者體內的微生物組群構成一定會有相應的改變,因為不同的基因突變可能會造成不同的癌癥類型,這些腫瘤也會對周圍的微生物組造成一定的影響"。來自民尼蘇達大學的Ran Blekhman博士說到。

該研究結果發表在2015年美國人類遺傳協會的會議上。

在該研究中,Blekhman與同事們比較了正常大腸細胞與大腸癌腫瘤細胞間的遺傳差異,他們發現特定的腫瘤相關基因突變與特異性的大腸寄生細菌有很大關系。  

例如,具有APC基因突變的人群易得腺瘤肉病(一類遺傳性的癌癥),同時他們體內腫瘤組織附近具有大量的梭桿菌。Blekhman博士指出他們實驗室*次分析了這種腫瘤相關突變與腫瘤周圍微生物組之間的關系。

研究者們通過全基因外顯子測序的手段分析了腫瘤組織周圍(或者對照正常組織周圍)的微生物組的組成。不同的突變往往與特定微生物類型種群豐度有相關性。另外,同一樣品內部如果遺傳突變越多,其周圍鑒定出的微生物種群類型也就越多。

通過突變手段,作者們發現如果腫瘤細胞內葡萄糖轉運通路被阻斷的話,微生物群所需的能量消耗也就越多。這說明在某些情況下腫瘤與周圍的微生物在競爭性地使用體內的資源。

之后,研究者們以微生物的種類與豐度為標準評估了一些腫瘤相關遺傳突變。這一結果能夠準確預測ZFN717基因的突變。該基因能夠編碼鋅指核酸酶用于DNA的修復。該結果也表明我們可以通過分析患者糞便中的微生物成分大致預測腫瘤的類型,而且理論上也可以通過控制腫瘤微環境預防、治療癌Dami    巨核細胞    
SPC-A-1    肺腺癌    
CHMas    肥大細胞白血病    
SGC-7901    胃腺癌    
HEL    紅細胞白血病 (Erythroleukemia)    
BGC-823    低分化胃腺癌    
HL-60    原髓細胞白血病 (Promyelocytic lenukemia)    
LoVo    結腸腺癌    
Hut-78    皮膚T細胞淋巴瘤    
Ls-174-T    結腸腺癌    
Hut-102    皮膚T細胞淋巴瘤    
HCT-8    回盲腸腺癌    
Namalwa    Burkitt`s淋巴瘤    
HCe-8693    盲腸未分化腺癌    
Jurknt. klone E6-1    白血病細胞    
HR-8348    直腸腺癌    
THP-1    單核細胞    
BEL-7402    肝癌    
U937    組織細胞淋巴瘤    
BEL-7404    肝癌    
Raji    Burkitt's淋巴瘤    
BEL-7405    肝癌    
MEG-01    成巨核細胞白血病    
HepG2    肝細胞癌    
L129    NCTC克隆929    
L-M TK    鼠胸腺激酶缺陷細胞株    
STO    鼠胚成纖維細胞系    
YAC-1    鼠T淋巴瘤細胞系    
MA-782    鼠乳腺癌細胞系    
GR    鼠成纖維細胞系    
NIH/3T3    鼠成纖維細胞系    
B16-Fo    鼠黑色素瘤細胞系    
B16-F1    鼠黑色素瘤細胞系    

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