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上海申知心生物科技有限公司
主營產品： 高血脂癥動物模型,心血管疾病動物模型,缺血性心臟病動物模型 |
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2017-11-16 閱讀(5400)
那天突然有人問我，miRNA是不是能做出那種network的網絡圖，就跟那種文章里一樣？
其實我自己也忘了到底應該怎么整了，簡單點的話，就自己去搜搜看miRNA怎么樣對應基因做成列表就行了吧。但是負責任的我，還是搜到了一些miRNA分析的工具。
對，就是上面這個工具，可以分析單個基因或者多個基因對單個miRNA和多個miRNA，實際上跟形成network圖沒什么關系。只是覺得這個做出來的東西，還蠻有意思的。我們可以搜多個miRNA與多個基因間的關系：
然后，它就會生成這么一個特別草率的二型網絡圖……
點擊里面的miRNA這邊的方塊，就能顯示miRNA分別對于各個靶基因的關系：
嗯，邊上還有一個kegg的圖標，這個是給你做好的這些靶基因位于哪些信號通路的結果，點一下就會顯示：
有這個基因所在的信號通路的位置，包含了它能結合的miRNA結合位點……可以直觀地看看miRNA到底作用在什么信號套路上。
當然，對于基因，也有相應的描述，比如，這個基因到底有多少個剪接異構本：
分別是哪些剪接異構本能結合你搜的這個miRNA：
可能你也沒考慮過不同的剪接異構本，受到的miRNA的調控不一樣吧……
