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　　對一個混合試樣成功地分離，是氣相色譜儀操作分析的前提和基礎。而其中氣相色譜分離條件的選擇至為關鍵。主要涉及以下幾個方面：
　　1.載氣對柱效的影響：
　　載氣對柱效的影響主要表現在組分在載氣中的擴散系數Dm(g)上，它與載氣分子量的平方根成反比，即同一組分在分子量較大的載氣中有較小的Dm(g)。根據速率方程：
　　（1）渦流擴散項與載氣流速無關；
　　（2）當載氣流速u小時，分子擴散項對柱效的影響是主要的，因此選用分子量較大的載氣，如N2、Ar，可使組分的擴散系數Dm(g)較小，從而減小分子擴散的影響，提高柱效；
　　（3）當載氣流速u較大時，傳質阻力項對柱效的影響起主導作用，因此選用分子量較小的氣體，如H2、He作載氣可以減小氣相傳質阻力，提高柱效。
　　2.載氣流速（u）對柱效的影響：
　　從速率方程可知，分子擴散項與流速成反比，傳質阻力項與流速成正比，所以要使理論塔板高度Hzui小，柱效zui高，必有一*流速。對于選定的色譜柱，在不同載氣流速下測定塔板高度，作H-u圖。
　　H-u圖曲線上的zui低點，塔板高度zui小，柱效zui高。該點所對應均流速即為*載氣流速。在實際分析中，為了縮短分析時間，選用的載氣流速稍高于*流速。
　　3.柱溫的選擇
　　柱溫是影響氣相色譜儀操作的重要參數之一，主要影響來自于K、k、Dm(g)、Ds(l)；從而直接影響分離效能和分析速度。
　　在實際分析中應兼顧這幾方面因素，選擇原則是在是在難分離物質對能得到良好的分離，分析時間適宜且峰形不托尾的前提下，盡可能采用較低的柱溫。同時，選用的柱溫不能高于色譜柱中固定液的zui高使用溫度。對于沸程寬的多組分混合物可采用“程序升溫法”，可以使混合物中低沸點和高沸點的組分都能獲得良好的分離。