熒光定量PCR儀有單通道,雙通道,和多通道。當只用一種熒光探針標記的時候,選用單通道,有多熒光標記的時候用多通道。單通道也可以檢測多熒光的標記的目的基因表達產物,因為一次只能檢測一種目的基因的擴增量,需多次擴增才能檢測完不同的目的基因片段的量。熒光定量PCR儀比普通的PCR儀多了熒光信號采集系統和計算機分析處理系統,實時熒光定量PCR儀主要是用來定量分析和確定基因轉錄水平的,而普通的PCR儀是做定性分析和擴增基因片段,定量PCR儀可以做普通PCR儀的工作,而反之就不行了,況且這樣代價太大了,一般的實驗室都不允許這樣做的。總之兩者的功能不能互相取代。
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