3月12日，由華東理工大學信息學院、梅斯醫(yī)學主辦，主題為“開放•鏈接•服務”的2016生物醫(yī)療大數(shù)據(jù)研討會暨華理-梅斯生物醫(yī)藥開放鏈接大數(shù)據(jù)研究中心成立儀式在華東理工大學舉行，來自復旦大學、交通大學-耶魯大學聯(lián)合生物統(tǒng)計中心、中科院系統(tǒng)生物學重點實驗室、曙光醫(yī)院、萬達信息等高校、科研機構(gòu)、醫(yī)療機構(gòu)和企業(yè)的300余位專家學者與會，圍繞大數(shù)據(jù)開放與共享、數(shù)據(jù)關聯(lián)，大數(shù)據(jù)關鍵技術與大數(shù)據(jù)在生物醫(yī)藥行業(yè)應用等話題展開研討。
同時，研究中心還向參會代表贈送了基于RDF(ResourceDefinitionFramework)格式，關聯(lián)基因、藥品與疾病的約1個G的開放鏈接數(shù)據(jù)(LinkedOpenData)集合。互聯(lián)網(wǎng) 時代，大數(shù)據(jù)被認為是改變行業(yè)的關鍵節(jié)點，生物醫(yī)療行業(yè)亦不例外。
據(jù)華東理工大學阮彤老師介紹，近年來，生物醫(yī)療行業(yè)的海量數(shù)據(jù)迅速形成，但相對于國外大量開放鏈接數(shù)據(jù)集對生物醫(yī)藥領域研究的促進發(fā)展，國內(nèi)的生物醫(yī)療行業(yè)數(shù)據(jù)封閉、分散且表示方式不一致，制約了整個行業(yè)的發(fā)展。為此，華東理工大學信息學院攜手上海梅斯醫(yī)學，在上海市經(jīng)濟與信息化委員會指導以及上海市大數(shù)據(jù)聯(lián)盟的大力支持下,成立了“生物醫(yī)藥開放鏈接大數(shù)據(jù)聯(lián)合研究中心”，旨在充分發(fā)揮雙方優(yōu)勢，提供開放的中文基礎生物醫(yī)藥數(shù)據(jù)，關聯(lián)國內(nèi)外已有的生物醫(yī)藥開放鏈接數(shù)據(jù)，搭建生物醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究公共服務平臺，為生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)挖掘工作提供更多的支撐和服務。
“醫(yī)療大數(shù)據(jù)與醫(yī)療的聯(lián)姻，為實現(xiàn)健康醫(yī)療的預防、治療、預后等提供了可行之路。”華東理工大學劉昌勝副校長表示，近年來，生物醫(yī)療行業(yè)的海量數(shù)據(jù)迅速形成，同時，伴隨著大數(shù)據(jù)處理關鍵技術的突破、數(shù)據(jù)開放等契機的發(fā)展，大數(shù)據(jù)將在促進行業(yè)發(fā)展中發(fā)揮重要作用。梅斯醫(yī)學董事長張發(fā)寶認為，當前衛(wèi)生信息化建設的發(fā)展很快，與醫(yī)藥相關的行業(yè)數(shù)據(jù)正在以的速度增長，大數(shù)據(jù)應用也已起步，開放醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的研究已成為熱點，一些大學著手成立大數(shù)據(jù)研究機構(gòu)，但是，在數(shù)據(jù)利用、技術應用等多方面仍然面臨諸多亟需解決的問題。據(jù)介紹，生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)挖掘是生物醫(yī)藥與信息技術的交叉學科。
在大數(shù)據(jù)挖掘方面，華東理工大學擁有計算機科學、數(shù)學以及統(tǒng)計學等學科優(yōu)勢，學生團隊曾榮獲2014年百度知識圖譜數(shù)據(jù)分析競賽一等獎，2015百度大數(shù)據(jù)競賽一等獎及特別貢獻獎，并且在西班牙舉辦的2015年語言學鏈接開放數(shù)據(jù)競賽中*。目前華東理工大學正與曙光醫(yī)院、萬達信息、上海申康合作，共同承擔國家863項目“心血管疾病與腫瘤疾病中西醫(yī)臨床大數(shù)據(jù)處理分析與應用研究”。華東理工大學在生物醫(yī)藥的相關研究領域工作中也取得了一系列成果，在藥物化學領域*期刊——美國《藥物化學》雜志上發(fā)表的研究論文數(shù)量也于國內(nèi)其他高等院校。按論文發(fā)表數(shù)量衡量，在*0研究機構(gòu)中，在“基于結(jié)構(gòu)的藥物設計”領域中與美國普渡大學并列第三。上海梅斯醫(yī)藥科技有限公司作為大的醫(yī)藥生物和醫(yī)療健康產(chǎn)業(yè)服務平臺，提供專業(yè)醫(yī)藥生物信息服務、臨床醫(yī)學研究協(xié)助服務、臨床研究成果轉(zhuǎn)化服務等。特別是在醫(yī)學領域具有核心的資源，在臨床醫(yī)學領域具有強大的學術團隊。
據(jù)悉，華理-梅斯生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)研究中心，將從開放鏈接大數(shù)據(jù)和專注多元化開發(fā)模式等方面為進一步推動生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的發(fā)展開展相關研究。通過開放鏈接大數(shù)據(jù)實現(xiàn)“開放•鏈接•服務”。基于基礎知識圖譜、提供數(shù)據(jù)下載、瀏覽、查詢、問答、語義標注等技術服務，并在此基礎上，提供電子病歷數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測、疾病分類、藥品成分查詢等業(yè)務服務。為社會公眾提供健康指導，為醫(yī)療與醫(yī)藥企業(yè)提供專業(yè)信息服務。在未來三年內(nèi)能為政府公共衛(wèi)生系統(tǒng)提供輔助決策咨詢服務，為醫(yī)院、醫(yī)藥企業(yè)提供疾病知識庫、藥品知識庫等的查詢服務、輔助治療服務。通過共享、反饋，促進知識庫的更新和發(fā)展，依托于上海大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新聯(lián)盟與中關村大數(shù)據(jù)聯(lián)盟，聯(lián)合各類醫(yī)療機構(gòu)與IT機構(gòu)，形成生物醫(yī)藥開放大數(shù)據(jù)社區(qū)，進而逐步實現(xiàn)“開放•鏈接•服務”的服務理念。專注多元化開發(fā)模式加速生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)創(chuàng)新。利用異構(gòu)數(shù)據(jù)抽取、整合、處理技術，知識圖譜技術，語義標注技術，醫(yī)藥大數(shù)據(jù)挖掘技術的研究及算法并行化改造技術，語義質(zhì)量控制技術等生物醫(yī)藥領域的關鍵技術展開研究。通過創(chuàng)新基地建設，有效解決現(xiàn)有系統(tǒng)封閉、資源分散等問題，大幅提升成果快速轉(zhuǎn)化擴散能力。
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