水浴恒溫振蕩器按振蕩方式可分往復式，回旋式及雙功能三種方式，按控溫范圍可分為常溫型和全溫型。
1、往復式水浴振蕩器具有較大的通氣量，能在較短時間內獲得理想的培養效果或混勻效果，而其在高速振蕩時，瓶內的溶液容易從瓶口溢出，所以在使用高速振蕩時應在瓶口加蓋聚四氟乙烯瓶塞。
2、回旋式水浴振蕩器在高速振蕩時瓶內液體不會溢出，但通氣量沒有往復式大，同時振蕩效果沒有往復式明顯，一般在做微生物培養時多選擇此類振蕩方式。
3、雙功能水浴振蕩器可根據使用要求選擇不同的振蕩方式，可以一機兩用。
4、常溫型水浴振蕩器是指控溫范圍在室溫-100℃之間，其控溫范圍隨著環境溫度變化而變化，一旦使用溫度超過低于環境溫度時，將無法工作，出現此種情況，應選擇全溫型水浴恒溫振蕩器。
5、全溫型水浴振蕩器是指控溫范圍在0-100℃之間，其工作溫度不受環境溫度影響。