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分離血清中蛋白,降低成本的好工具

閱讀:390        發(fā)布時(shí)間:2023-3-3

患者樣本中存在的一些生物分子能夠?yàn)榧膊≡\斷提供關(guān)鍵的檢測指標(biāo),例如疾病代謝物和蛋白質(zhì)標(biāo)記物。現(xiàn)有的分離方法通常采用沉淀法,費(fèi)時(shí)昂貴且要條件優(yōu)化。本文中,我們通過使用 NMR 和 Off-Gel 方法來進(jìn)行評估,展示了如何通過超濾快速、精確、高效地分離血清中生物分子。

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下載本篇《Vivaspin® Turbo 4 PES: 一種分離疾病代謝物和蛋白質(zhì)的經(jīng)濟(jì)方法》應(yīng)用說明,了解超濾系統(tǒng)如何在經(jīng)濟(jì)效益,具有同樣的有效性質(zhì),簡單易操作的前提下完成該過程。


目前,人們普遍采用多重親和去除系統(tǒng)(Multiple Affinity Removal System, MARS)從人血清、血漿和其他生物液體中分離高豐度蛋白質(zhì)(白蛋白、IgG、抗胰蛋白酶、IgA、轉(zhuǎn)鐵蛋白和結(jié)合珠蛋白)。去除這些高豐度蛋白質(zhì)可以有效地?cái)U(kuò)大動態(tài)范圍,從而改善血清樣本的LC/MS和電泳結(jié)果。但是,使用該系統(tǒng)會給用戶帶來高昂的成本(4×w.r.t.超濾)。

我們通過超濾的方式,以蛋白質(zhì)的大小和結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),在驅(qū)動力(通常由離心或壓力條件產(chǎn)生)下將樣品通過膜分離。

具體步驟如下

1、濃縮管制備

用 0.1NHCl沖洗Vivaspin® Turbo 4,重復(fù)沖洗 3 到 4 次。


2、樣品采集、超濾和分析


  • 從患者身上抽取血樣并提取血清

  • 使用 Vivaspin® Turbo 4,50kda MWCO PES(4000g,7min)高豐度血清蛋白

  • 使用 Vivaspin® Turbo 4,3kDa MWCO PES 濃縮濾液(4000g,7min)

  • 濃縮物的Off-Gel進(jìn)行區(qū)帶分離分離(蛋白質(zhì)>3kDa)

  • 超濾透過液的核磁共振(代謝產(chǎn)物<3kDa)


以上步驟即可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)從代謝物中分離,但是需要注意的是用去離子水進(jìn)行預(yù)沖洗無法有效去除干擾物,因此在核磁共振圖譜中觀察到雜質(zhì)峰(圖1)。因此使用0.1NHCl溶液進(jìn)行預(yù)沖洗(一個濃縮管的預(yù)沖洗量為12 ~ 14 mL,是Vivaspin® Turbo 4PES的 3 ~ 4 倍)。

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圖1. 核磁共振圖譜


結(jié)論

通過Off-Gel分離對濃縮物進(jìn)行分析(圖2),含有小代謝物的濾液則通過核磁共振進(jìn)行分析(圖3)。因此超濾方式是簡單高效的,對一個樣本的分析成本估計(jì)會是MARS的四分之一。

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(左)圖2. 對健康個體(頂部)和患病個體(底部)的 血清中蛋白質(zhì)進(jìn)行的Off-Gel分離分析

(右)圖3. 對健康個體(頂部)和患病個體(底部)血清中代謝物進(jìn)行的核磁共振分析




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