藻類分析可直接分析大尺寸范圍的浮游藻類、團體結構，可現場分析微囊藻群體結構變化。
藻類分析主要功能
1.專業分析浮游植物細胞，同時具備傳統流式細胞儀經典功能
2.可以掃描記錄各種光學信號（散射、熒光）的動態變化
3.可實現高頻、原位分析水體微生物群落及優勢種變化
4.可在完整的藻類粒徑譜范圍內對生物量進行線性評估
5.可直接分析大尺寸范圍的浮游藻類、團體結構，可現場分析微囊藻群體結構變化
6.可調式PMT可根據檢測粒徑大小調節檢測器靈敏度
7.流動成像技術可對感興趣感興趣的聚群進行圈門設定后專門拍照
8.脈沖信號指紋圖譜技術，圈門直觀方便，更真實反應細胞形態
9.水下測量(CytoSub)可在整個真光層分析浮游植物動態
10.可整合入浮標中或其它載體上進行在線監測，可配合CTD對水體做剖面測量
11.實現實驗室遠程控制基站式自動在線監測，可實現自動檢測，無人值守在線監測
測量參數
光學參數：前向散射FWS、側向散射SWS，熒光散射FLR、FLY、FLO
形態參數：能同時獲得包括細胞和顆粒形態物理特性（數量、長度、大小、形態、粒度、色素、峰數等）、群體特征、脈沖圖譜等在內的9個拓撲學指標及最少45組參數
絕對計數：自然水體總顆粒計數，圈門后可集群計數及濃度計算，可實現鏈狀藻單細胞數計數功能
其他測量參數：分析體積、進樣速率等
應用領域
1.海洋生態學與淡水生態學
2.流域監測與管理
3.海洋學與湖沼學
4.有害藻華（HABs）預警
5.微藻生物技術
6.河流、水庫、湖泊、海洋的監測與管理
7.監測與管理
8.水源地、水廠、污水處理廠的水質監測
9.富營養化研究
10.藻類環境生物學
11.水產養殖
選購指南：
一、便攜式浮游植物流式細胞儀CytoSense
系統組成：
流式細胞儀分析主機：相干高質量連續固態激光器，標配波長488nm,可選波長445nm、635nm、640nm、660nm等，最多可配置7個檢測器（檢測通道含FWSL+R、SWS、YF、RF、OF）。
野外便攜式外殼：儀器采用碳素纖維外殼，防濺水設計，更輕便（<15kg）,整機安裝于輕質鋁質框，帶高質量防震墊。包裝于便攜式航空箱內。
數據分析系統：藻類分析含便攜式筆記本電腦，預裝數據采集軟件CytoUSB,和數據分析軟件CytoClus
批量處理數據分析軟件EasyClus:需購買MatLab軟件配合使用
高速流動成像模塊：可選。
二、系統組成：
主機：淺水版Cytosub（水下20米），含CytoSense所有基本配置
浮標模塊：包括浮標、太陽能電池板、充電電池、浮標燈、電子系統、無線傳輸裝置和采樣管防水連接器等。根據用戶需要，也可擴展為易拆卸浮標模塊，這樣用戶可以非常方便的在CytoSense（室內用）和CytoBuoy（在線監測）間轉換。
注意：野外在線監測時不僅僅限于以浮標作為平臺，其他平臺也可，只要可以具備放置CytoSense的空間及供電即可。同時，增加Bacterialstainingmodule，可實現水體異養微生物自動染色和在線分析，可在線檢測藻類、細菌、浮游動物及沉積物等顆粒。
CytoBuoy浮體
CytoBuoy通訊模式：無線通訊
三、水下浮游植物流式細胞儀——CytoSub
主機：臺式機CytoSense是防濺水設計，可以在野外使用，但不能水下使用。CytoSense加上一個水下模塊（SUBMODULE）就組成了水下式流式細胞儀CytoSub。
水下模塊：一個耐受200m水深壓力的防水外殼，閥門和進樣環路部分（包括循環泵），電子控制單元，數采，水下連接器和支架。
工作模式一：AUV搭載
利用英國國家海洋中心AutoSub型AUV搭載CytoSub
工作模式二：水下垂直剖面分析
與CTD結合一起測量
注意：此外，水下型浮游植物流式細胞儀CytoSub可應用于浮標，Ferrybox等監測平臺，在垂直剖面不同層位獲取浮游植物生物量信息，對研究微囊藻沉浮機制，浮游動物、水文、水質等因素對浮游植物生態位影響提供數據依據。
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