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一步法同源重組

2017-9-7  閱讀(4525)

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不讓您寶貴的克隆留下“疤痕”!

提起傳統酶切連接克隆或載體構建,什么讓大家苦不堪言?  

A:每次都要糾結于各種限制性內切酶的選擇。                    

B:操作步驟繁瑣,耗時長,至少需三四天才能完成。

小C每次只能克隆1個目的片段。

D:片段結合位置上有時會留下“疤痕”。

······

忘記苦難,今天小編給大家介紹一種新的克隆方法—一步法同源重組技術,帶你們脫離苦惱!

一步法同源重組一種利用同源重組的原理,進行無縫克隆的技術。該技術無需考慮酶切位點,幾乎適用于任何載體與任何片段的定向克隆。操作過程簡單快速,只需50℃,20min即可完成反應。勁爆的是,多個片段也可以同時克隆哦!

 

激動寶寶小C:如此厲害,是如何做到呢?

【秘】一步法同源重組的關鍵在于重組酶它由三種酶混合而成分別是外切酶,DNA聚合酶和連接酶。

外切酶活性:該酶能沿著5’→3’方向,降解雙鏈DNA,從而產生黏性末端,這樣便于與另外的同源末端進行配對結合(兩個同源序列通過外切酶的切割,能產生幾乎一致的黏性末端)。

DNA聚合酶活性:外切酶作用后,并不能保證將每一個片段的5’末端都降解成一樣長的黏性末端,同源末端退火配對后,極可能存在缺失的堿基。此時需要借助DNA聚合酶進行修復缺口。

連接酶活性:催化形成磷酸二酯鍵,將所有缺口補齊,實現無“疤痕”拼接,即無縫克隆。

好奇寶寶D:外切酶降解雙鏈DNA多長呢?是否會把雙鏈DNA切割成單鏈導致無法進行片段重組呢

莫擔心自有妙招的重組反應溫度是50℃遠高于外切酶的zui適溫度(37℃),此外,外切酶的含量較低,故重組反應體系中很快會失去外切酶活性。對于200bp以上的雙鏈DNA-片段都是*不用擔心的,當然,幾十bp的小片段是不適合同源重組的。

心急寶寶小B:這么牛掰的,快給我們講講怎么操作吧。

步驟1:制備載體

需將線性化載體的制備好,既可以選擇酶切,也可以選擇PCR的方式制備線性化載體。

步驟2:設計目的片段引物

在目的片段上下游引物的5’端引入15-25bp左右載體末端同源序列

步驟3:擴增目的片段

通過PCR的方法,使目的片段的兩端加上了與載體末端相應的同源序列。

步驟4:重組反應

按比例混合線性化載體和目的片段50℃反應20 min。

步驟5:轉化,鑒定

將重組產物直接轉化后涂平板,挑取克隆進行陽性鑒定。

 

機智寶寶小A:有啥應用呢?

可以應用于定點突變,CRISPR,構建多順反子表達載體等等

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