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8道毛細管3500系統和24道毛細管3500xL系統，可升級
的導熱系統設計，更好滿足DNA片段分析時對溫度控制的嚴格要求。
505 nm單波長固態長壽激光源——采用標準電源供電，無需散熱
同儀器之間不同運行之間以及不同毛細管之間的信號強度*性得到顯著改善
強大、綜合的數據采集和初步分析軟件，提供了數據質量的實時評估
無線射頻識別（RFID）技術追蹤關鍵消耗品數據并記錄管理信息
的多色熒光分析能力，可對DNA片段進行多達6種不同熒光染料的多重檢測
*的應用靈活性——一種毛細管陣列、一種聚合物分離膠，通用于大部分研究應用
簡單的安裝、操作和維護——迄今為止容易擁有、方便運行的DNA測序儀
系統組件及消耗品
Applied Biosystems 3500和3500xL基因分析儀包含下列組件:
· 毛細管電泳儀
· 8道毛細管（3500系統）或24道毛細管（3500xL系統）毛細管陣列及高分子分離膠
· DNA測序和/或片段分析系統的試劑及耗材
· Dell計算機工作站及液晶顯示器
· 整合的軟件，用于儀器控制、數據采集、質量控制，及用于堿基檢出和片段篩分的樣品文件自動分析
Applied Biosystems提供了以下消耗品，用于3500系列系統：
毛細管陣列：內部無覆層的毛細管是以每個陣列上組裝8或24根毛細管的形式提供，有著內置的框架，便于安裝。陣列分為36 cm和50 cm兩種毛細管長度，支持多種應用及運行方法。50 cm陣列已針對多種應用進行優化，可采用POP-7? 高分子聚合物（膠）及特定的運行模塊。這簡化了用戶選擇并使其運行時間縮短到與上一代36 cm陣列相似 。3500和3500xL毛細管陣列定制 進樣160次。
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