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NIS-Elements 軟件包括多個獨立的軟件版本，滿足不同的應用需求。各個版本都有智能化操作界面，簡化操作流程，提供強大的圖像工具，對圖像進行各種分析。

NIS-Elements AR (Advanced Research)

      NIS-Elements AR針對高級研究應用進行了優化。可以進行全自動的拍攝和分析，zui多可達6維操作。 (X,Y,Z,Lambda(波長),T, multi stage points（多視野）).
同時提供完備的圖像處理和可視化工具。比如5D視圖，自動目標計數，熒光強度隨時間的變化，大視野拼接，去模糊，圖像庫，共定位，景深擴展等等。
通過圖像庫，可以有效提高實驗效率。歸檔，查詢，分析大量多維圖像。為用戶的前沿研究提供了很多便利，比如活細胞成像。

NIS-Elements BR (Basic Research )

     NIS-Elements BR 適用于標準的研究應用。比如對熒光圖像進行歸檔和分析。zui多可以進行4維拍攝，對設備進行高級控制。

BR 可以輕松控制外圍設別拍攝多維圖像（多達4維），并進行回放，數據管理，分析（比如： X,Y,Z, Lambda (波長))。此外還提供高級處理功能，比如自動計數，熒光強度隨時間變化，數據庫，生成報告，景深擴展等等。

通過圖像庫，可以有效提高實驗效率。歸檔，查詢，分析大量多維圖像。為用戶的前沿研究提供了很多便利，比如活細胞成像。

NIS-Elements D  (Documentation)

      NIS-Elements Documentation的功能包括拍攝，測量與計數，圖像庫管理和生成報告。操作簡單，菜單經過簡化。

適用于臨床和工業應用，比如組織比較，圖像存儲和生成報告，顆粒分析，缺陷分析，纖維和織物材料分析扥等。

主要功能包括：手動測量長度，面積，大視野拼接；圖像過濾，生成PFD基礎的報告，景深擴展 (EDF), 實時比較，自動測量，自動計數，參數過濾，數據輸出，高級宏功能。（部分功能需要插件）

NIS-Elements C (confocal Imaging)

     NIS-Elements C是共聚焦成像的高級軟件套裝。可搭配尼康高速高分辨率共聚焦顯微鏡A1+/A1R+、多光子共聚焦顯微鏡A1 MP+/A1R MP+、共聚焦顯微鏡C2+及光譜共聚焦成像系統搭配使用。

其直觀軟件界面通過簡單的設置即可實現復雜的實驗流程設計，如多維時間序列成像與光活化實驗。所有共聚焦的基本操作步驟都可在一個界面下完成。軟件同時具備圖像濾鏡、平均、圖像補償及給類圖像處理與分析的高級功能。

  |  功能簡介            

  |  多維拍攝               

NIS-Elements 整合了 X, Y, Z, Lambda (波長), Time（時間）, 和 Multi Stage Points（多視野）成像方式，從而實現了多維成像(取決于軟件的功能模塊)。所有的多維組合圖像都以ND2序列的格式保存，可以一個單窗口的智能化操作界面對多維圖像進行回放和處理，分析。

  | 反卷積                   

  | 2D反卷積

     去掉熒光焦外模糊信號，從而得到高信噪比的清晰圖像。可實時對2D預覽圖像進行去模糊處理。（AR版可選）

  | 3D反卷積

     對Z軸序列拍攝的厚樣品圖像序列進行去模糊處理，可得到如共聚焦圖像般的清晰切層照片。 （AR版可選）

  | 鈣離子與FRET實驗   

此插件用于鈣離子測量與FRET實驗分析。FRET分析使用“three-filter”方法并可以進行鈣離子濃度的校正。使用three filter的Gordon方法可以校正FRET效率。（AR版可選）

  | 目標跟蹤                  

對物體動態成像的數據進行目標跟蹤可以獲得其運動速度、距離、方向等指標。并可輕松到處數據進行進一步的分析。 （AR版可選）

  | 景深擴展                  

       Extended Depth of Focus (EDF) 景深擴展模塊, 首先拍攝一組不同Z軸位置的圖像，由于每個位置都只有一部分圖像是聚焦清楚的，所以分析后進行處理，得到一張“全聚焦”圖像。而且可以生成立體圖像和3D表面圖像，從而得到虛擬3D圖像。

   |  圖像庫功能            

       NIS-Elements提供了功能強大的圖像庫模塊，支持各種圖像和Meta數據。可以輕松生成各種數據庫和表格，只需單擊鼠標就可以實現圖像的入庫存儲。過濾，排序，分組功能，使得圖像的管理異常方便。