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DNA專題:DNA純化實驗

2013-7-22  閱讀(1664)

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實驗方法原理
本試劑盒適合從各種瓊脂糖凝膠中提取多至 8 μg DNA(70 bp-10 Kb),回收率為 60-85%。瓊脂糖凝膠在溫和的緩沖液(DE-A 溶液)中溶解,其中的保護劑能防止線狀 DNA 在高溫下降解,然后在 DE-B 溶液的作用下使 DNA 選擇性結合到膜上。純化的 DNA 純度高,并保持片斷完整性和高生物活性,可直接用于連接、體外轉錄、PCR 擴增、測序、微注射等分子生物學實驗。
 
實驗材料
試劑、試劑盒
儀器、耗材
實驗步驟
一、試劑盒組成、貯存、穩定性
 
1.  說明書,耗材:DNA 制備管、2 ml 離心管、1.5 ml 離心管。
 
2.  Buffer DE-A:凝膠熔化劑,含 DNA 保護劑,防止 DNA 在高溫下降解。室溫密閉貯存。
 
3.  Buffer DE-B:結合液(促使大于 70 bp 的 DNA 片段選擇性結合到 DNA 制備膜上)。室溫密閉貯存。若出現沉淀,應于 70°C 溫育溶解并冷卻至室溫后再使用。
 
4.  Buffer W1:洗滌液,室溫密閉貯存。
 
5.  Buffer W2 concentrate:去鹽液,使用前,根據瓶上數量加入乙醇,混合均勻,室溫密閉貯存。可用
100%無水乙醇或 95%乙醇。
 
6.  Eluent:2.5 mM Tris-HCl,pH 8.5,室溫密閉貯存。
 
二、實驗準備
 
1.  *次使用前,Buffer W2 concentrate中加入體積的無水乙醇。
 
2.  準備無核酸和核酸酶污染的Tip頭、離心管。
 
3.  準備75°C水浴。
 
三、操作步驟
 
1.  在紫外燈下切下含有目的 DNA 的瓊脂糖凝膠,用紙巾吸盡凝膠表面液體并切碎。計算凝膠重量(提前記錄 1.5 ml  離心管重量),該重量作為一個凝膠體積(如 100 mg = 100 μl 體積)。
 
2.  加入 3 個凝膠體積的 Buffer DE-A,混合均勻后于 75°C 加熱(低熔點瓊脂糖凝膠于 40°C 加熱),間斷混合(每 2-3 min),直至凝膠塊*熔化(約 6-8 min)。
 
3.  加 0.5 個 Buffer DE-A  體積的 Buffer DE-B,混合均勻;當分離的 DNA 片段小于 400 bp 時,加入 1個凝膠體積的異丙醇。
 
步驟 4-6 可以選擇負壓法或離心法。
 
A.  負壓法
 
4A.  正確連接負壓裝置,將 DNA 制備管插到負壓裝置的插口上。吸取步驟 3 中的混合液,轉移到制備管中,開啟并調節負壓至-20-30 英寸汞柱,緩慢吸走管中溶液。
 
.  加 0.5 ml Buffer W1,吸盡管中溶液。
 
6A.  加 0.7 ml Buffer W2,吸盡管中溶液。以同樣的方法再用 0.7 ml Buffer W2 洗滌一次。
 
*  確認在 Buffer W2 concentrate 中已按試劑瓶上的體積加入無水乙醇。
 
B.  離心法
 
4B.  吸取 3 中的混合液,轉移到 DNA 制備管(置于 2 ml  離心管)中,12 000×g 離心 1 min。棄濾液。
 
5B. 將制備管置回離心管,加 0.5 ml Buffer W1,12 000×g 離心 30 s,棄濾液。
 
6B.  將制備管置回離心管,加 0.7 ml Buffer W2,12 000×g 離心 30 s,棄濾液。(可選步驟)以同樣的方法再用 0.7 ml Buffer W2 洗滌一次 12,000×g 離心 1 min。
 
*  確認在 Buffer W2 concentrate 中已按試劑瓶上的體積加入無水乙醇。
 
7.  將制備管置于 2 ml 離心管中,12 000×g 離心 1 min。
 
8.  將制備管置于潔凈的 1.5 ml  離心管中,在 DNA 制備膜正中央加 25-30 μl  水或 Eluent,室溫靜置1 min。12 000×g 離心 1 min 洗脫 DNA。
 
展開 
注意事項
1.  在步驟 1 中,將凝膠切成細小的碎塊可大大縮短凝膠熔化時間(線型 DNA 長時間暴露在高溫條件下易于水解),從而提高回收率。勿將含 DNA 的凝膠長時間地暴露在紫外燈下,減少紫外線對 DNA造成的損傷。
 
2.  在步驟 2 中凝膠必須*熔化,否則將嚴重影響 DNA 回收率。
 
3.  將 Eluent 或水加熱至 65°C,有利于提高洗脫效率。
 
4. DNA 分子呈酸性,建議在 2.5 mM Tris-HCl

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