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技術講解:禽流感病毒的類型及結構簡介
點擊次數:1030 發布時間:2013-4-18
禽流感病毒(AIV)屬甲型流感病毒。流感病毒屬于RNA病毒的正黏病毒科,分甲、乙、丙3個型。其中甲型流感病毒多發于禽類,一些亞型也可感染豬、馬、海豹和鯨等各種哺乳動物及人類;乙型和丙型流感病毒則分別見于海豹和豬的感染。
甲型流感病毒呈多形性,其中球形直徑80~120nm,有囊膜。基因組為分節段單股負鏈RNA。依據其外膜血凝素(H)/和神經氨酸酶(N)蛋白抗原性的不同,目前可分為16個H亞型(H1~H16)和9個N亞型(N1~N9)。

禽流感病毒
禽流感病毒聚合酶的晶體結構
近年來,由H5N1亞型禽流感病毒引起的疫情廣泛傳播對人類的健康造成性的重大威脅。因此揭示與流感病毒密切相關的蛋白質的三維結構不僅對揭示流感病毒復制機制具有重要科學意義,而且對開發抗流感病毒藥物具有重要價值。zui近,由中科院生物物理研究所劉迎芳研究員領導的研究組和饒子和院士領導的研究小組在這一領域取得突破性進展,他們在上揭示了流感病毒聚合酶關鍵部分PA亞基與PB1多肽復合體的精細三維結構。
流感A病毒聚合酶由三種蛋白組成——PA、PB1和PB2,是轉錄和復制的關鍵。現在,兩個小組報告了禽流感病毒H5N1 PA 的C-端區域在與PB1的PA結合區域所形成的復合物中的晶體結構。這項結構研究對于新型抗病毒藥物的設計可能會有用。
流感病毒基因組含有8個RNA片段,已知可以編碼11種病毒蛋白質。其中,由PA,PB1和PB23個亞基組成的聚合酶復合體是負責病毒基因組RNA復制以及病毒mRNA轉錄的關鍵組分,同時由于它的高度保守性、低突變率,成為抗流感病毒藥物設計的重要靶點。多年來的研究認為,PB1是病毒RNA聚合酶的催化亞基,負責病毒RNA的復制以及轉錄;PB2是負責以一種稱為“Snatch”的方式奪取宿主mRNA的CAP帽子結構用于病毒mRNA轉錄。而PA亞基不但參與病毒復制過程,而且還參與病毒RNA轉錄、內切核酸酶活性、具有蛋白酶活性以及參與病毒粒子組裝等多種病毒活動過程,因而在整個聚合酶復合體的研究中顯得格外重要。在經過晶體生長條件篩選、晶體質量優化、高分辨率數據收集、相位解析、電子密度圖解釋以及結構修正等難關,他們利用全新的思路,解析了PA與PB1氨基端多肽蛋白復合體的2.9埃分辨率晶體結構。該結構清晰顯示了PA與PB1多肽相互作用模式,發現該作用位點的氨基酸殘基在流感病毒中高度保守,這為廣譜抗流感(包括人流感和禽流感)藥物研究提供了一個理想的靶蛋白。同時,根據該復合體結構以及已知的一些蛋白突變體研究結果,推測了PA亞基在聚合酶中作用,為進一步功能研究提供了分子基礎。這一復合體結構的揭示,對揭示流感病毒聚合酶作用機制以及開展針對流感病毒藥物設計工作都具有十分重要意義。