磷脂酰膽堿由一個膽堿的“頭部"和甘油酸磷脂組成，甘油酸磷脂的尾部可以是各種各樣的脂肪酸。通常，一條尾部是飽和的脂肪酸（可以是棕櫚酸，也叫十六烷酸；或者十七烷酸，最早由Gobley在蛋黃中發現），另外一條是不飽和脂肪酸（例如油酸，最早由Gobley發現）。但是也有一些是兩條都是飽和脂肪酸的。例如，動物肺部的磷脂酰膽堿，有較高部分比例的二棕櫚酰磷脂酰膽堿。

高效液相色譜法(HPLC)和其它色譜法是獲得高純度單組分的有效方法，但無論薄層色譜或是高效液相色譜，處理量都很小，不適合制備大量高純度的磷脂酰膽堿。快速柱層析法是色譜法的一種，操作簡便，迅速，分離效果好，無論是少量制備或是批量生產柱色譜是分離純化磷脂酰膽堿的一種有效的方法。

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