合理定期的維護對維護任何設備的正常工作都是至關重要地，這一點對生物安全柜也不例外。按照下面推薦的維護日程表對安全柜進行維護，保持其性能。
一．每日維護
1) 用70%的酒精（其他殺菌劑視用戶使用的材料而定）*對安全柜內部工作區域表面、側壁、后壁、窗戶進行表面凈化。不要用含有氯的殺菌劑，因為它可能對安全柜的不銹鋼結構造成損壞。也要對紫外燈和電源輸出口表面進行清潔。當清潔安全柜內部區域時，操作人員除了手放以外，身體的其他任何部位不能進入安全柜
2) 檢查警報并檢測基本氣流
二．每周維護
1) 用70%的酒精（其他殺菌劑視使用的材料而定）*對排水槽進行清洗
2) 檢查俘獲紙孔處的殘留物質
三．每月維護
1) 用濕布對安全柜外部表面進行擦拭，尤其是安全柜的前面和上部，把堆積的灰塵打掃干凈。
2) 檢查所有的維護配件的合理使用情況。
3) 上述每日工作中的條目
四．每季維護
1) 檢查安全柜的任何物理異常或故障。檢查熒光顯像管確保它們工作正常
2) 當不銹鋼上表面有難以去除的斑點時，可以使用MEK(methyl-ethyl-ketone)。使用WEK后，快速用清水和液體清潔劑沖洗不銹鋼板，并且用聚亞安酯布或者海綿進行擦拭。定期清潔不銹鋼表面會使之保持表面的光滑美觀。
五．每年維護
1) 具備資格的認證技術人員對安全柜進行性能認證。
2) 更換紫外燈
3) 上述的每季維護
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