色譜柱是運用于色譜儀系統中起著分離作用的儀器，是色譜儀分析系統的核心部件，色譜柱柱效的高低影響著檢測速率的快慢以及檢測結果的準確性。對色譜柱的要求是柱效高、選擇性好，分析速度快。色譜柱的性質（粒度、粒徑分布等）、填充料、柱長、固定相和流動相的種類等都是影響色譜柱柱效的因素。因此，為了提高色譜柱的柱效，保證液相色譜儀分析檢測的靈敏性，了解液相色譜柱的結構性能尤為重要。
色譜柱空柱是由柱接頭、柱管及濾片組裝而成。柱接頭是兩端螺紋組件，采用低死體積結構，一端是7/16英寸外螺紋，另一端是3/16英寸的內螺紋 (國內外已規范化)。7/16英寸外螺紋與1/4英寸柱管(Φ6.35mm)連接，中間放置壓環用于密封。3/16英寸的內螺紋與1/16英寸 (Φ1.57mm)的連接管連接，中間也放置壓環用于柱接頭的密封。為了盡量減少柱外死體積，提高色譜柱柱效。在安裝色譜柱時，用Φ1.57mm連接管通 過空心螺釘壓環后要盡量插到底，然后再擰緊空心螺釘。壓環被空心螺釘擠壓變形后緊箍在連接管上(連接管通過壓環后露出的管長度應嚴格控制在2．5mm長或 其他固定尺寸)。
在兩端柱接頭內，柱管兩端各放置一片不銹鋼濾片(或濾網)，用于封堵柱填料不被流動相沖出柱外而流失。空柱各組件均為316#不銹鋼材質，能耐受 一般的溶劑作用。但由于含氯化物的溶劑對其有一定的腐蝕性，故使用時要注意，柱及連接管內不能長時間存留此類溶劑，以避免腐蝕。
液相色譜柱的分離作用是在填料與流動相之間進行的，液相色譜柱的分類是依據填料類型而定。
正相柱：多以硅膠為柱填料。根據外型可分為無定型和球型兩種，其顆粒直徑在3—10 μm的范圍內。另一類正相填料是硅膠表面鍵合—CN，-NH2等官能團即所謂的鍵合相硅膠。
反相柱：主要是以硅膠為基質，在其表面鍵合十八烷基官能團(ODS)的非極性填料。也有無定型和球型之分。常用的其他的反相填料還有鍵合C8、C4、C2、苯基等，其顆粒粒徑在3—10 μm之間。
正相色譜柱的使用方法
1.新柱子可直接用流動相。推薦先用正己烷-乙腈（99：1）以0.5ml/min的流速沖10倍柱體積，再根據流動相選用極性相近的氯或二氯甲烷以相同的流速沖10倍柱體積，zui后換成流動相；
2.正相使用時，不宜分析含醛基、羰基的化合物，不可用于還原糖的分析；流動相要*脫氣，并不得含有羰基化合物和過氧化物（質量不好的億醚、四氫呋喃含有少量）；
3.任何時候更換流動相時都要確保新流動相與柱子原保存液可互溶。
反相色譜柱的使用方法
1.先用正己烷-乙腈（99：1）以0.5ml/min的流速沖10倍柱體積，再依次以相同的流速相同的用量用氯、異丙醇、甲醇、甲醇-水（50：50）沖柱子；
2.以0.5ml/min的流速用30倍柱體積的pH11.0的氫氧化鈉（LUNA）水溶液沖柱子（注意pH值切不可超過11.0），立即用水（ 0.5ml/min的流速，30倍柱體積）沖洗，再換成流動相；
3.配制流動相時，應各組分分別量取，比例較小的組分要精密量取，需調pH值時要精密到0.1；
4.反相條件下使用時，要特別注意控制pH值范圍，pH值越低越有發生水解的危險，流動相中水的比例越高當然也越有發生水解的危險。的pH范圍在pH 3.0-7.0；
5.如果要使用的流動相中還含有緩沖鹽類，建議在用分析流動相之前，先用不含緩沖鹽的同比例流動相過渡，這樣可避免緩沖鹽在分析柱內的析出。
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