離子色譜柱的分離原理：使用表面有離子交換基團的離子交換劑作為固定相。帶負電荷的交換基團（如磺酸基和羧酸基）可以用于陽離子的分離；帶正電荷的交換基團（如季胺鹽）可以用于陰離子的分離。不同離子與交換基的作用力大小不同，在樹脂中的保留時間長短不同，從而被相互分離。
離子色譜柱分類：
一、陰離子交換色譜柱
二、陽離子交換色譜柱
三、陰陽離子同時檢測色譜柱
四、離子排斥柱
五、生物樣品分析用離子色譜柱
離子色譜法的主要優點是可以同時檢測樣品中的多中成分，只需很短的時間就可以得到陰陽離子以及樣品組成的全部信息，但這種同時檢測的能力樣品中不同成分之間的巨大濃度差的限制。分離柱的穩定性取決于柱填料的類型，離子色譜法中用得廣的填料是苯乙烯/二乙烯基苯聚合物。這種樹脂的高pH穩定性允許用強酸或強堿做淋洗液，有利于擴大應用范圍。
樣品的前處理：
a、最好使用流動相溶解樣品。
b、使用前處理柱除去樣品中的強極性或與柱填料產生不可逆吸附的雜質。
c、使用0.45μm的過濾膜過濾除去微粒雜質。
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