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一：膠回收常見問題及
二：PCR產物回收試劑盒可能出現問題及解決方法
三：質粒抽提常見問題解答
四：基因組DNA抽提
五：RNA操作指南
六：Trizol疑難解答
七：PCR疑難解答
八：RT-PCR
九：RACE

 膠回收常見問題及對策

1. 沒有回收到DNA片段
如在洗脫后，發現洗脫液中沒有DNA 片段，請檢查是否按瓶身標簽，在洗滌液中加入了無水乙醇。
 

2. 提取率低
1） 融膠液為酸性緩沖液，如融膠后，其pH 值升高將影響提取得率。請加入0.1 倍體積的3M 乙酸鉀（pH5.0）。
2） 長時間使用后沒有更換的電泳緩沖液，其pH 值較高，將影響DNA 的吸附。請更換新的電泳緩沖液后，再進行電泳，然后切膠。
3） 回收片斷大小影響回收效率（見下圖）；
4） 在洗脫前，將洗脫液于30～60℃溫浴，可提高提取效率適當延長洗脫時間可增加回收效率。
5） 正確估計膠大小，確保加入足夠量的Binding Buffer；使膠*融解；
6） 提高Binding Buffer用量可提高小片斷DNA回收效率.對于<100bp的DNA片斷,可加入6倍體積的Binding Buffer；

3. 吸光度測量結果問題
吸光度測量的是未知樣品與調零標準之間的相對吸光度，所以請用與洗脫液體相同的液體，對測量樣品進行稀釋和調零。

4.如何計算提取率
1） 由于回收前樣品中，往往含有非目的DNA 片段、引物、dNTP 等，所以不能用測回收前后吸光度的的方法計算回收率。
2） 可將回收前后DNA 片段一起電泳，使用凝膠成像系統拍照后，用配套的軟件進行電泳條帶灰度對比。
3） 注意，電泳條件及拍攝條件將對灰度對比結果造成很大影響，請仔細操作，以減小誤差。

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PCR產物回收試劑盒可能出現問題及解決方法

1. 無DNA

DNA Wash Buffer沒有用無水乙醇稀釋；

2. 低DNA產量

樣品中加入的Binding Buffer的量太少；請按照使用說明加入足夠量的Binding Buffer；若DNA片段長度小于200bp，可加入6倍體積的Binding Buffer；若DNA片段長度大于4kb，則加入3倍體積Binding Buffer后加入1倍體積的雙蒸水。

3. OD值與瓊脂糖凝膠中的DNA產量不相符

從柱子上洗脫下來的痕量雜質增加了A260的值；請按照標準步驟操作；另一方面,還取決于瓊脂糖/EB電泳的質量.

4.  點樣時樣品漂出孔外

在洗滌完之后沒有把柱上的乙醇*除去；甩干空柱,然后再進行下面的洗脫步驟.

質粒抽提常見問題解答

1. 沒有DNA被洗脫出來

沒有用乙醇稀釋Wash Buffer，按前面指導的方法準備DNA Wash Buffer

2. DNA產量低

a. 細胞裂解率低

只使用含有氨芐青霉素的LB或YT培養基.使用基本方案時，不要使用超過5ml的高拷貝質粒培養物.

在加入Solution‖前細胞沒有充分混勻，可漩渦振蕩懸浮液使之充分混勻.加入Solution‖后，延長孵育時間可獲得清晰的裂解液.如果Solution‖沒有蓋緊，可能需要重配.可按以下準備：0.2N NaOH，1%SDS.

b. 細菌培養物生長過度或不新鮮

不要于37℃培養超過16小時，分離質粒前長時間存放培養物是不利的.

c. 使用的是低拷貝數質粒

增加培養物的體積至10ml，或使用質粒小量提取試劑盒II，培養物體積為25ml.

3. 產量中有大分子量的DNA污染

加入Solution‖后過分混和細胞裂解液，加入Solution‖后不要猛烈振蕩或搖勻，可輕輕顛倒離心管幾次使充分混勻

4. 光密度與瓊脂糖凝膠上的DNA不符

從柱子洗脫下來的痕量雜質使A260升高；確保按操作指南中的步驟7和8洗脫柱子；另外，還依賴于瓊脂糖／溴化乙錠電泳測定

5. 瓊脂糖凝膠上可見RNA帶

SolutionI沒有加入RNase A

6. 在瓊脂糖凝膠上點樣時，質粒漂出點樣孔

洗脫步驟后，乙醇沒有*從柱子上去除；按標準操作步驟中*甩干spin-column。