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均質器是樣品處理過程中的儀器，常用的均質器主要是高速旋轉刀片式均質器和拍擊式均質器。
拍擊式均質器，是使用無菌均質袋，拍擊的機械裝置作用在均質袋上，將樣品拍擊碎。對于硬性樣品，均質袋容易破損。無菌均質袋一次樣品一個袋子。
高速旋轉刀片的均質器，它由大功率高速電機通過連軸器帶動裝在刀座上的攪拌刀高速旋轉，將樣品快速勻漿、均質。多樣品處理，固體樣品干打粉碎研磨，濕打勻漿均質，液體，固體，硬性固體樣品都可以處理。一批樣品一套杯子。套杯可以高溫滅菌重復使用。
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