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布魯克 GeoMx DSP 數字空間多組學分析系統
布魯克 GeoMx DSP 數字空間多組學分析系統以特異性解析組織異質性在組織空間背景下精準解析不同組織功能區域中不同細胞群理解組織異質性對于研究發育生物學、疾病發生發展機制以及對治療的響應極為重要。布魯克 GeoMx DSP 數字空間多組學分析系統彌補了組織成像和分子表達檢測(如單細胞測序等)之間的鴻溝,支持您從空間多組學角度解鎖新的生物學見解。
技術原理
布魯克 GeoMx DSP 數字空間多組學分析系統采用傳利技術在抗體或者RNA上偶聯DNA Oligo。每個DNA Oligo對應一個靶標,最高可達96個蛋白靶標或>1000個RNA靶標(二代測序輸出)。當抗體或RNA與組織上的靶標結合后,GeoMx Digital Spatial Profiler利用激光切斷DNA oligo與抗體或RNA之間的連接物,從而釋放出DNA Oligo以進行下一步定量。
主要特點:
1. 多靶標:可在-張FFPE組織 上定份析高達10000多種RNA或最高96種蛋白質
2. 原位:采用1-4種熒光抗體染色獲取組織的形態學信息
3. 多維度:既可定分析蛋白質,也可定量分析RNA
4. 高精度:可達單細胞水平
5. 精準定量:采用數字化單分子計數技術,最高達106水平
6. 樣本無損:整個操作過程對樣本無損傷,利于保存珍貴樣本
7. 高通量: -天可分析多達12份組織樣本
彈性專注于您感興趣的目標區域
科研者可以靈活的圈選策略,高效地理解組織結構。由于不同組織的特點,研究人員往往在單一載玻片上可能對某一區域特別感興趣。在保留組織樣本完整性的情況下,GeoMx Digital Spatial Profiler可以允許使用者在單張載玻片上根據組織輪廓選取感興趣區域(Region Of Interest, ROI),甚至選取稀有細胞群體進行分析。
工作原理
利用標準IHC方法,將成像試劑(熒光標記的抗體或探針)、定量試劑(DNA條形碼標記的抗體或探針)和組織切片進行雜交孵育。在DSP儀器中完成組織成像、感興趣區域(ROI)圈選,接下來與感興趣區域形狀匹配的紫外光束照射該區域,使得該區域內的DSP條形碼得以釋放并被自動收集,進而利用高通量測序(NGS)進行表達定量,最終得到的是組織中不同空間區域的表達譜信息。
1. 樣本制備:任何樣本(FFPE或新鮮冷凍樣本);任何形態學標記物;檢測RNA和/或蛋白質。
2. 樣本檢測:利用GeoMx DSP對RNA和蛋白質進行自動化組織成像和分子檢測。
3. 表達定量:利用NGS進行表達定量。
4. 數據分析:預置的數據處理流程,交互式數據分析界面。