/ 微生物分子分型實驗數據分析技術服務
- 公司名稱 廣東西邁科技有限公司
- 品牌 Ridom
- 型號 /
- 產地
- 廠商性質 代理商
- 更新時間 2025/3/26 13:56:38
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PFGE 以其重復性好,分辨力強而被譽為細菌分子分型技術的“金標準”。它可以用于大分子DNA的分離,其分辨范圍達到10 Mb。PFGE選用識別低頻率酶切位點的內切酶切割基因組DNA,獲得的DNA大片段在外加脈沖電場的低濃度瓊脂糖凝膠中分離,產生數量有限的DNA條帶,在凝膠上按染色體片段長度的不同而呈現出電泳帶型,從而實現對菌株分型以檢測菌株的基因多態性。
MLST 是基于細菌核苷酸序列比對的一種分子分型方法,其原理是通過比較細菌個體7個或者更多管家基因的核苷酸序列的多態性,確定其基因多態性,同時通過劃分序列群和構建最小生成樹來揭示細菌群體遺傳結構。
MLVA 是基于細菌基因組中多個位點的數目可變化的串聯重復序列核心序列的拷貝數的差異來對不同細菌個體進行分型的一種技術。MLVA具有快速高通量易于操作等優點,不僅能確定基因多態性,而且能揭示細菌群體遺傳結構特征。
使用PFGE、MLST、MLVA中的一種或者綜合使用多種分型方法,可以揭示細菌的基因多態性和群體遺傳結構,結合細菌的三間分布信息以及其他生物學信息(如耐藥特征、特殊表型、毒力基因檢測)等可以進行細菌的流行特征、傳播機制、變異特征分析,以及特殊意義克隆群的甄別等研究;另外還可以為后續的研究,如全基因組測序、致病機制研究等項目篩選具有基因組代表性的測試菌株。
另外,我司還提供其它分子分型服務,例如ERIC-PCR、RAPD等,以及宏基因組、耐藥基因譜、毒力基因譜檢測和數據分析等技術服務。
數據分析服務內容:
PFGE typing
RiboPrinter typing
MLST analysis、MLVA typing
MALDI、AFLP、RFLP、RAPD
REP-PCR、ARDRA、DGGE、TGGE
Whole genome MLST
Antibiotic resistance profiling
Community fingerprinting
Hetero-Duplex Analysis (HDA)
HIV drugresistance prediction
ISSR-PCR using QIAxcel
ITS typing
MIRU-VNTR typing
MLPA analysis
Molecular surveillance
Sequence-based typing
Sequence repeat typing
spa-typing
Taqman-based SNP genotyping