iTRAQ定量蛋白質組學
- 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產地
- 廠商性質 經銷商
- 更新時間 2024/3/11 11:07:52
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實驗介紹
iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技術是一種多肽體外標記技術。該技術采用4-plex或8-plex同位素的標簽，通過特異性標記多肽的氨基基團，進行LC-MS/MS分析，可同時比較多種不同樣本中蛋白質的相對表達含量
實驗流程
*包括蛋白質定量、SDS-PAGE測試、酶解和質譜分析，對樣本質量及樣本之間的平行性進行初步判斷。
應用方向
生物領域各個研究方面，如：
? 農林領域：抗逆脅迫機制，生長發育機制，育種保護研究等
? 畜牧業：肉類及乳品質研究，致病機理研究等
? 基礎醫學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等
? 生物醫藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發等
? 微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產：漁業資源，海水養殖，漁業環境與水產品安全等
? 生物能源、環境科學領域：發酵過程優化，生物燃料生產，環境危定風險評估研究等
? 食品營養：食品儲藏及加工條件優化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發，食品安全監檢測等
數據分析
標準數據分析內容 | |
蛋白質總鑒定數量分析 | 蛋定與定量結果統計、差異結果統計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質功能分析 | 亞細胞定位、結構域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網絡分析 |
質量控制分析 | 肽段離子質量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質豐度比分布 |
高級數據分析內容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關聯的核心蛋白質 |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質的表達趨勢模式 |
技術優勢
? 具有2-8 plex標簽，可同時標記2-8組樣本進行表達差異分析
? 是一種體外標記技術，可標記動物、植物、微生物、臨床、體液或細胞等多種樣本
? 不同標簽混合后上機，具有較好的平行性，避免技術誤差，提高檢測效率
? 與凝膠方法相比，iTRAQ可發現膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、強堿和強酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白質，對低豐度蛋白質亦有較好的檢出率
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