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PhenoWatch系列溫室-田間表型分析系統

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 上海澤泉科技股份有限公司(Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.)成立于2000年,是一家專注于科研設備研發、系統集成、技術推廣、咨詢、銷售和科研服務的科技型技術企業。公司注冊資金3500萬元人民幣,具有進出口貿易權。
 
公司總部位于上海浦西,在北京設有分公司,在廣州、成都、武漢分別設有代表處。公司全體員工均具有高等教育背景,其中80%的技術研發、技術支持和銷售人員具有碩士和博士學位,參加過很多國家和省部級重大科研項目,具有豐富的科研工作經驗。公司曾獲得上海市普陀區科技小巨人企業、上海市科技型企業中華全國工商聯合會/上海市工商聯合會/上海市商會會員單位,曾是上海市專業技術服務平臺——生理生態測量與分析平臺的依托單位和上海市高新技術成果轉化項目承擔單位。2012年公司通過了ISO9001質量管理體系認證,獲得AAA信用資質等級認定,獲得普陀區科技小巨人企業認定,成為上海市研發公共服務平臺加盟單位和“上海市工商聯合會”/“上海市商會”會員單位 。2015年獲得“專精特新”中小企業認定。2016年成為“上海市生態學學會常務理事單位”和“上海種子行業協會”會員單位,2017年成為“上海市農業工程學會理事單位”。
 
上海澤泉科技股份有限公司非常注重自主知識產權的申報和保護,截止2021年底已獲得發明6項、實用新型53項及軟件著作9項,國內外科研期刊發表科研論文20多篇。公司還參與承擔了國家自然科學基金重點項目(41030529)和水利部948項目(200907)。
 
公司秉承推進中國生態環境改善、農業興國的理念,服務涉及植物表型組學和基因組學、植物生理生態、土壤、環境氣象、水文水利、氫農業等領域的科研和技術支持,服務對象主要為各級科研單位、高校和政府機構。公司先后為科技部“973”項目和“863”項目、國家科技重大專項、國家科技支撐計劃、國家“211”工程和“985”工程、中科院知識創新工程、農業部“948”項目、水利部“948”項目等提供技術咨詢、儀器設備、系統解決方案和系統集成服務,為項目的順利完成提供了有力支持。
 
多年來,公司積極參與相關領域的學術會議,并定期舉辦相關儀器設備的技術講座和培訓班,在科研和監測領域產生了積極的反響,獲得了良好的口碑。截止2021年底,澤泉科技舉辦公開技術講座200多場,參會人員超過10000人次;同時在國內外應邀參加學術會議和展會200多次,與相關領域的客戶有非常密切的交流合作。
 
2014年2月,上海澤泉科技股份有限公司在上海浦東孫橋現代農業園區投資成立了上海乾菲諾農業科技有限公司,建設了AgriPhenoTM “高通量植物基因型-表型-育種服務平臺”,為植物科研和育種單位提供全面的樣品收集和栽培,實驗設計和項目合作,以及表型數據與生物信息學分析綜合服務。平臺成功主持了上海張江國家自主創新示范區專項發展資金重點項目“澤泉科技高通量植物基因型-表型-育種服務平臺”。作為主持單位或合作單位參與了上海市農委和科委的30多項政府科研服務項目以及商業服務項目,如科技興農種業發展項目“農作物分子育種的技術創新研究”和“青菜高通量表型圖譜標準的建立及主要性狀分析”、科技興農重點攻關項目“基于圖像分析及三維建模技術的黃瓜長勢快速評價方法研究”、 “蘭科觀賞花卉分子育種技術研究與產業化應用”等。為了緊追世界科技發展水平,開啟院企合作建立研究型平臺的創新嘗試,上海澤泉科技股份有限公司與上海市農業科學院,結合雙方各自的優勢,于2021年5月在上海農業科學院莊行試驗站聯合成立“上海市農業科學院莊行綜合試驗站澤泉科技植物表型技術研究平臺”,AgriPhenoTM平臺從上海浦東孫橋現代農業園區整體遷出,并入新建的植物表型技術研究平臺。目前平臺除擁有無人機表型平臺、溫室型和實驗室型高通量表型分析系統外,還擁有現代化溫室、生物學實驗室、植物生理生態測量設備、農業氣象測量系統和專業的數據庫平臺,已經具備了對植物、動物基因測序與植物表型研究的各類條件。可以承擔高通量DNA提取、基因測序服務、分子輔助育種、植物生理生態研究等科研實驗任務。同時可以為植物功能基因組、農業育種家提供高通量植物基因型測試、高通量植物表型測試和植物基因型-表型生物信息學數據分析等開放式服務。
 
公司積極響應上海市政府“崇明生態島建設”的發展方向,2016年12月澤泉科技在崇明城橋鎮投資成立了子公司—上海金盞農業發展有限公司,擴展建設田間智能化育種服務平臺,以及智能化農業物聯網“農業云平臺”,以生態鄉村、能源鄉村的發展模式,展示并實施公司自主研發的先進的農業樓宇基礎設施、溫室與田間的智能化“多因子”調控的栽培管理模式;擬建成擁有田間型高通量表型分析系統的“AgriPheno智能化育種服務平臺”,提高上海種業商業化育種的進程,并服務于全國和國外相關育種科研單位。
 
展望未來,上海澤泉科技股份有限公司希望在社會多方資源的支持和關懷下,不斷提升自己,為社會提供更多、更優秀的產品和服務!
 

CI-340手持式光合儀;CI-203手持式激光葉面積儀;CI-202葉面積儀;CI-110冠層分析儀;CI-600根系生長監測儀

產地類別 進口 應用領域 環保,生物產業,農業

PhenoWatch高通量植物表型分析系統


基于Sensor to Plant理念設計的移動式高精度植物表型成像系統


PhnoWatch高通量植物表型分析系統,深度集成了激光雷達、高光譜成像、紅外熱成像、多光譜成像與RGB成像單元,可智能化移動至不同測量區域,按預設值自動掃描作物,生成含多光譜信息的三維影像,進行群體植物的單株識別,單株植物的莖葉分離,精準獲取植物株高、株幅、葉長、葉寬、葉傾角、葉面積、郁閉度、冠層透光率等表型參數,結合光譜特征進行植被指數的計算,及冠層溫度與生物量的統計分析。


1. PhenoWatch硬件系統


PhenoWatch高通量植物表型分析系統的硬件,主要分3D中央成像單元,溫室或田間移動平臺。

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3D中央成像單元(Sensor Box)

點云模塊:激光雷達,具有雙軸補償器和高度傳感器,及角測量功能,對每次掃描進行水平校準,現場自動設備補償,進行精度更高、距離更遠的掃描,獲取植物空間點云,三維建模,最終實現植物群體參數和單株形態表型參數的提取。

紅外熱成像模塊:用于機器視覺的外熱像儀,配備了非制冷式氧化釩紅外探測器,高精度紅外熱成像CCD,能夠生成640x480像素的熱圖象,具有較高的圖像質量,可視化顯示線性ROI溫度值、溫度剖面圖。

高光譜成像模塊:圖像中每一象素都記錄了其對應樣品點的化學組成、質量、顏色等信息的光譜特征,用于對植物進行生物量的定性與定量分析。

多光譜成像模塊:以五通道(Blue、Green、Red、NIR、RedEdge)光譜影像為數據源,通過影像與點云的匹配融合從而為三維空間點云賦予光譜信息,最終實現三維的植被指數計算。

RGB成像模塊:高分辨率的RGB相機,色彩影像與點云匹配融合,以保障在獲取高精度三維影像的同時,還原植物真實的色彩。

 

移動平臺

根據現場環境實況,移動平臺的尺寸與結構可以靈活設計:

多場景適用,可以結合現有溫室結構、植物培養架來設計,可以在溫室使用,也可以在野外使用; 

移動平臺的尺寸訂制化程度高,根據安裝條件靈活設計,跨度可以大于10 m,高度可以大于5 m,導軌長度可以大于1000 m;

自動化程度高,定義大車在導軌上的移動方向為X軸,Sensor Box在橫梁上的移動軸向為Y軸,Sensor Box在豎直方向的調節軸向為Z軸,可以實現X、Y、Z三軸的自動化控制,可以按空間坐標定位移動,可以按設定距離移動;

覆蓋區域廣,可以大跨度設計,也可以一臺多跨設計,即一臺龍門架,可以在多壟地塊之間橫跨掃描;

方式多樣,可以門式結構設計,天車式結構設計,或推車式設計;

定位精度高,多重限位保護,安全性高。


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PhenoWatch-GF野外龍門架式植物表型成像系統


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PhenoWatch-GH溫室天車式植物表型成像系統


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PhenoWatch-MB溫室龍門架式植物表型成像系統


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PhenoWatch-MB野外移動版植物表型成像系統


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PhenoWatch植物培養架版植物表型成像系統



2. PhenoWatch軟件系統

PhenoWatch系統采集到的作物3D點云數據與圖像信息能夠通過PhenoWatch軟件進行數據融合與三維建模,對群體作物進行數據提取,獲得郁閉度、冠層透光率、植被指數等群體參數;基于深度學習算法——Faster-RCNN模型,識別單株作物根部位置,利用傳統生長法完成群體分單株,然后進行植物的莖葉分割,軟件內嵌的莖葉分割方法有兩種:基于區域生長法莖葉分割,基于體素法莖葉分割。

基于生長法莖葉分割是基于區域生長法識別和分割單株植物的莖和不同葉片,基于體素法莖葉分割是基于深度學習識別和分割單株植物的莖和不同葉片,然后將不同葉片和主干生成獨立點云文件,并對葉片和主干擬合表面與骨架線,進而計算株高、株幅、葉長、葉寬、葉傾角和葉面積等表型參數。 

PhenoWatch的軟件是一款專門針對于作物三維表型參數提取的軟件系統,最新版本的PhenoWatch軟件集成了神經網絡技術和深度學習算法,極大提高了作物單株分割及莖葉分割處理的精度。該軟件使用并行處理及GPU 加速,進一步提升了海量點云數據處理的速度。軟件具備的作物的單株分割和莖葉分割算法,從不同尺度上滿足了作物基因型-表型研究者對作物形態參數提取的需求。此外,我們還提供定制化的數據處理模塊的開發服務。

PhenoWatch分析軟件處理點云數據過程:


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植物骨架3D到2D投影與曲線擬合算法               植物骨架2D到3D投影與曲線擬合算法          

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植株骨架線分析與提取

3. 測量參數

群體參數:

數字高程模型DEM:即地形表面形態的數字化表達。

數字地表模型DSM:指包含了地表建筑物、橋梁和植被等高度的地面高程模型。

            l  冠層高度模型CHM:從數字表面模型中減去數字高程模型即可得到冠層高度模型。



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郁閉度Canopy Cover:農作物的垂直投影占大田面積的百分比。

冠層透光率Transmittance:即作物不同高度層片上可接收到的入射太陽光比例。

3D點云植被指數:

      3D NDVI、3D TVI、3D RVI、3D DVI等。

2D植被指數:

      2D NDVI、2D TVI、2D RVI、2D DVI等。

植被指數統計:多光譜植被指數的統計,如均值、最大值、最小值等

植物綠色程度:自定義閾值,反映植物綠色程度

熱紅外分析:圖像各像素點溫度,植物冠層溫度(配熱紅外成像單元)

統計群體表型參數的報表,各植株的高度、冠幅、投影面積、冠高比和體積,及數據統計:

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單株表型參數:


高度                                冠幅                                投影面積                                 冠高比

體積                                葉片數量                         總葉面積                                 葉長

葉寬                                葉傾角                             葉面積                                    主干寬

            l  導出單株表型參數報表:

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4. 強大的可擴展功能

系統可根據不同研究需要,擴展選配成像模塊,實現更多功能


可選模塊1:植物多光譜相機

400-900nm的波段范圍,5波段,涵蓋紅、綠、藍、近紅外、紅邊,可進行NDVI等多種植被指數的計算,滿足作物多光譜研究的應用。

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多光譜模塊可獲得葉綠素分布、NDVI、數字表面模型、RGB圖像

 

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    多光譜植被指數NDVI成像分析 多光譜植被指數DVI成像分析     多光譜植被指數SR成像分析       


可選模塊2:紅外熱成像模塊

熱紅外成像模塊內置非制冷式氧化釩(VoX)紅外探測器,能夠生成640 x 480像素的熱圖像,使熱像更加準確;配有高速紅外窗口選項;清晰顯示50 mk的溫度差;內置的25°鏡頭,帶電動對焦和自動對焦。分析軟件具有點測溫、線測溫、橢圓區域測溫、矩形區域測溫,以及其溫度最值、平均值、Delta函數統計功能,同時記錄輻射率、大氣溫度、外部光學溫度、相對濕度等信息,以達到獲取熱成像圖有用信息的目的。

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紅外熱成像定點分析                          紅外熱成像等溫分析                  

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紅外熱成像數據分析

可選模塊3:高光譜成像模塊

配置高光譜成像模塊,高光譜成像系統將可見光近紅外(VNIR或NIR)光譜與高分辨率成像相結合,采用推掃式(pushbroom)成像技術對運動的樣品或在運動中對靜止的樣品進行逐線全波段光譜采集并同步生成圖像,獲取樣品化學成分的量化數據以及空間分布等詳細信息,圖像中每一象素都記錄了其對應樣品點的化學組成、質量、顏色等信息的光譜特征,用于對樣品進行定性、定量分析。


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高光譜成像及高光譜曲線分析

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高光譜-小麥葉片斑枯病監測

5. 主要技術參數:

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6.  應用案例

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玉米植株群體激光雷達測量結果

 

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群體內單株玉米的識別


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植株內單個葉片的識別與測量

 

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作物冠層覆蓋度測量分布成像

 

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作物植被指數二維成像及數據顯示

 

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作物植被指數三維假彩色視圖


產地:以色列 OLAN公司




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