本品是一種新型的局部外用抗生素，是熒光假單胞菌培養液中產生的一種代謝物質，即假單胞菌A。

主要通過可逆性地與異亮氨酸轉移RNA合成酶結合，阻止異亮氨酸摻入，終止細胞內含異亮氨酸的蛋白質合成，導致細菌死亡。在低濃度時有抑制作用，高濃度時有殺菌作用。

對與皮膚感染有關的各種革蘭陽性球菌，尤其是葡萄球菌(包括耐藥金黃色葡萄球菌)、化膿性鏈球菌高度敏感；對單核細胞增生性李斯特菌及紅斑丹毒絲菌也有效；對革蘭陰性菌一般不敏感，但對某些革蘭陰性菌如大腸桿菌、奈瑟菌屬、流感嗜血桿菌和淋球菌具有一定的抗菌作用；對大多數厭氧菌以及皮膚正常菌群不敏感；對真菌效力低。

藥涂于皮膚后，能滲透達角質層下，但吸收率很低。與人血清蛋白的結合率為95%。吸收后可迅速代謝成無活性物單孢酸(MonicAcid)，經腎臟排泄。

大多數敏感葡萄球菌屬的抑菌濃度為0.01～0.25mg/L，敏感鏈球菌為0.06～0.5mg/L，李斯特菌為8mg/L。體外試驗本品在酸性條件下比在堿性條件下更有效。在人血清存在時，其活性降低為1/10～1/20。目前在我國臨床上莫匹羅星主要用于治療由金黃色葡萄球菌和鏈球菌所致各種感染性皮膚病：原發性皮膚感染，如膿皰瘡、毛囊炎和癤癰等；繼發性皮膚感染，如濕疹、異位性皮炎、皮膚潰瘍、手術傷口、小面積燒傷、皮膚外傷；其他還可用于小傷口、切口以及其他滅菌性病損的預防感染。